技術 早産を予測するためのバイオマーカーの対

0001

本願は、２０１６年２月３日に出願された米国仮特許出願第６２／２９０，７９６号、２０１５年１２月２４日に出願された米国仮特許出願第６２／３８７，４２０号および２０１５年６月１９日に出願された米国仮特許出願第６２／１８２，３４９号の優先権の利益を主張し、これらの米国仮特許出願の各々の全体の内容は、本明細書中に参考として援用される。

0002

本発明は、一般的に、精密医療の分野に、より具体的には、妊娠女性において早産についての確率を決定するための組成物および方法に関する。

0003

背景
世界保健機関によると、推定１５００万人の乳児が毎年（妊娠満３７週前）早産で生まれる。信頼性の高いデータを伴うほぼ全ての国において早産率が増加している。世界保健機関；Ｍａｒｃｈ ｏｆ Ｄｉｍｅｓ；Ｔｈｅ Ｐａｒｔｎｅｒｓｈｉｐ ｆｏｒ Ｍａｔｅｒｎａｌ， Ｎｅｗｂｏｒｎ ＆ Ｃｈｉｌｄ Ｈｅａｌｔｈ； Ｓａｖｅ ｔｈｅ
Ｃｈｉｌｄｒｅｎ， Ｂｏｒｎ ｔｏｏ ｓｏｏｎ： ｔｈｅ ｇｌｏｂａｌ ａｃｔｉｏｎ ｒｅｐｏｒｔ ｏｎ ｐｒｅｔｅｒｍ ｂｉｒｔｈ、ＩＳＢＮ９７８９２４１５０３４３３（２０１２年）を参照のこと。推定１００万人の乳児が早産の合併症により毎年死亡している。世界的には、早産が、新生児の第１の死亡原因（生後４週間内の乳児）および５歳未満の小児における肺炎に続く第２の死亡原因である。多くの生存者は、学習障害ならびに視覚および聴覚の問題を含む、障害の人生に直面する。

0004

信頼性の高いデータを伴う１８４カ国にわたり、早産率は、生まれた乳児の５％〜１８％の範囲である。Ｂｌｅｎｃｏｗｅら、「Ｎａｔｉｏｎａｌ， ｒｅｇｉｏｎａｌ ａｎｄ ｗｏｒｌｄｗｉｄｅ ｅｓｔｉｍａｔｅｓ ｏｆ ｐｒｅｔｅｒｍ ｂｉｒｔｈ．」、Ｔｈｅ Ｌａｎｃｅｔ、９；３７９巻（９８３２号）：２１６２〜７２頁（２０１２年）。早産の６０％超がアフリカおよび南アジアで発生しており、早産は、それにもかかわらず、世界的な問題である。最多数を伴う国は、ブラジル、インド、ナイジェリア、および米国を含む。１５％を上回る早産率を伴う１１カ国の内、２カ国を除く全てが、サハラ以南アフリカである。最貧国においては、高所得国における９％と比較して、平均で、乳児の１２％が、あまりにも早く生まれている。国内では、貧困家庭でリスクが高い。未熟児の４分の３超が、実施可能な、費用対効果の高いケア、例えば、乳児の肺を強化するための、早期陣痛のリスクのある妊娠女性に与えられる出生前ステロイド注射で助けることができる。

0005

早産で生まれた幼児には、死亡ならびに種々の健康および発達の問題について、満期で生まれた幼児よりも大きなリスクがある。合併症は、急性呼吸器、消化器、免疫、中枢神経系、聴覚、および視覚の問題、ならびに長期的な運動、認知、視覚、聴覚、行動、社会的情緒、健康、および成長の問題を含む。早産児の誕生はまた、家族にかなりの感情的および経済的コストをもたらし、公的サービス、例えば健康保険、教育、および他の社会的支援のシステムなどについての意味を有しうる。死亡および罹患の最大のリスクは、最も初期の妊娠期間に生まれた幼児についてのものである。しかし、満期により近くで生まれた幼児が、早産で生まれた幼児の最多数を代表しており、満期で生まれた幼児よりも多くの合併症を経験する。

0006

超音波で子宮頸管開口部を示す妊娠２４週未満の女性において早産を防止するために、子宮頸部を強力な縫合糸で縫合閉鎖する頸管縫縮術として公知である外科的手技を用いることができる。妊娠３４週未満および能動的な早期陣痛中の女性については、入院、ならびに早期陣痛を一時的に停止するおよび／または胎児の肺発達を促進するための医薬の投与が必要となりうる。妊娠女性で早産のリスクがあると判断された場合、医療提供者は、予防内服、例えばカプロン酸ヒドロキシプロゲステロン（Ｍａｋｅｎａ）注射および／または膣プロゲステロンジェル、子宮頸ペッサリーなど、性的活動および／または他の身体活動に対する制限、ならびに早期陣痛のリスクを増加させる慢性状態、例えば糖尿病および高血圧などのための処置の変更を含みうる、種々の臨床戦略を実施することができる。

0007

早産のリスクがある女性を特定し、適した産前ケアを提供する必要性は高い。ハイリスクとして特定された女性では、より集中的な出生前サーベイランスおよび予防的介入について計画を立てることができる。リスク評価のための現在の戦略は、産科歴ならびに病歴および臨床検査に基づいているが、これらの戦略では、早期出産のリスクがある女性のわずかなパーセンテージを特定することしかできない。現在は、自然ＰＴＢ（ｓＰＴＢ）の前歴が、それ以降のＰＴＢに関する最も強力な単一の予測因子である。ｓＰＴＢを以前に一度経験している場合、第２のＰＴＢの可能性は３０〜５０％である。他の母体リスク要因としては、黒色人種であること、母体の体格指数が低いこと、および子宮頚部長が短いことが挙げられる。ｓＰＴＢを予測するための羊水、頸腟液、および血清バイオマーカーの研究によると、最終的に早期分娩する女性には、複数の分子経路に異常があることが示唆されている。早産についてのリスクの信頼できる早期特定は、早期出産を防止するための適当なモニタリングおよび臨床管理の計画を可能にするであろう。そのようなモニタリングおよび管理は、より頻繁な胎教来診、連続的な子宮頸管長の測定、早期早産の徴候および症状に関する教育の強化、変更可能なリスク行動のためのライフスタイル介入、禁煙、子宮頸部ペッサリーおよびプロゲステロン処置を含みうる。最後に、早産についてのリスクの信頼できる出生前特定も、モニタリングリソースの費用対効果の配分に決定的である。
有リスク女性を特定しようとする研究が精力的に行われているにもかかわらず、臨床的および人口統計学的要因にのみ基づくか、または測定された血清または膣バイオマーカーを使用するＰＴＢ予測アルゴリズムは、臨床的に有用な検査に至っていない。臨床介入を可能にするためには、初回妊娠中および妊娠初期に有リスク女性を特定するためのより正確な方法が必要である。本発明では、妊娠女性に早産のリスクがあるか否かを決定するための組成物および方法を提供することにより、この必要性に対処する。関連する利点も提供する。

0008

世界保健機関；Ｍａｒｃｈ ｏｆ Ｄｉｍｅｓ；Ｔｈｅ Ｐａｒｔｎｅｒｓｈｉｐ ｆｏｒ Ｍａｔｅｒｎａｌ， Ｎｅｗｂｏｒｎ ＆ Ｃｈｉｌｄ Ｈｅａｌｔｈ； Ｓａｖｅ ｔｈｅ Ｃｈｉｌｄｒｅｎ， Ｂｏｒｎ ｔｏｏ ｓｏｏｎ： ｔｈｅ ｇｌｏｂａｌ ａｃｔｉｏｎ ｒｅｐｏｒｔ ｏｎ ｐｒｅｔｅｒｍ ｂｉｒｔｈ、ＩＳＢＮ９７８９２４１５０３４３３（２０１２年）
Ｂｌｅｎｃｏｗｅら、「Ｎａｔｉｏｎａｌ， ｒｅｇｉｏｎａｌ ａｎｄ ｗｏｒｌｄｗｉｄｅ ｅｓｔｉｍａｔｅｓ ｏｆ ｐｒｅｔｅｒｍ ｂｉｒｔｈ．」、Ｔｈｅ Ｌａｎｃｅｔ、９；３７９巻（９８３２号）：２１６２〜７２頁（２０１２年）

0009

概要
本発明は、妊娠女性において早産の確率を予測するための組成物および方法を提供する。

0010

本発明は、表２６に示されている群から選択される単離されたバイオマーカーを提供する。本発明のバイオマーカーは、妊娠女性の早産リスクを予測することができる。一部の実施形態では、単離されたバイオマーカーは、ＩＢＰ４、ＳＨＢＧ、ＰＳＧ３、ＬＹＡＭ１、ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ、ＩＢＰ３、ＩＮＨＢＣ、ＰＳＧ２、ＰＥＤＦ、ＣＤ１４、およびＡＰＯＣ３からなる群から選択される。

0011

本発明は、表２６に示されている群から選択される単離されたバイオマーカーの代用ペプチドを提供する。一部の実施形態では、単離されたバイオマーカーの代用ペプチドは、表２６に示されている代用ペプチドの群から選択される。本発明のバイオマーカーおよびそれらの代用ペプチドは、妊娠女性の早産リスクを予測するための方法に使用することができる。一部の実施形態では、代用ペプチドは、ＩＢＰ４、ＳＨＢＧ、ＰＳＧ３、ＬＹＡＭ１、ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ、ＩＢＰ３、ＩＮＨＢＣ、ＰＳＧ２、ＰＥＤＦ、ＣＤ１４、およびＡＰＯＣ３からなる群から選択される単離されたバイオマーカーに対応する。

0012

本発明は、表２６に示されている群から選択される代用ペプチドに対応する安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を提供する。本発明のバイオマーカー、それらの代用ペプチド、およびＳＩＳペプチドは、妊娠女性の早産リスクを予測するための方法に使用することができる。一部の実施形態では、ＳＩＳペプチドは、ＩＢＰ４、ＳＨＢＧ、ＰＳＧ３、ＬＹＡＭ１、ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ、ＩＢＰ３、ＩＮＨＢＣ、ＰＳＧ２、ＰＥＤＦ、ＣＤ１４、およびＡＰＯＣ３からなる群から選択される単離されたバイオマーカーの代用ペプチドに対応する。

0013

本発明は、表２６に列挙されている単離されたバイオマーカーからなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対であって、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で比値の変化を示すバイオマーカーの対を提供する。

0014

本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対であって、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で比値の変化を示すバイオマーカーの対を提供する。

0015

本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対であって、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で比値の変化を示すバイオマーカーの対を提供する。

0016

一実施形態では、本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対であって、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すバイオマーカーの対を提供する。

0017

一実施形態では、本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対であって、バイオマーカーの前記対が各々、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示す、対を提供する。

0018

一実施形態では、本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応する代用ペプチドの対を含む組成物であって、バイオマーカーの対が、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示す組成物を提供する。一実施形態では、組成物は、代用ペプチドの各々の安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0019

一実施形態では、本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応する代用ペプチドの対を含む組成物であって、バイオマーカーの前記対が、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示す、組成物を提供する。一実施形態では、前記組成物は、代用ペプチドの各々の安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0020

特定の実施形態では、本発明は、満期対照と比較して早産リスクのある妊娠女性間で反転値の変化を示す単離されたバイオマーカーの対ＩＢＰ４／ＳＨＢＧを提供する。さらなる実施形態では、本発明は、満期対照と比較して早産リスクのある妊娠女性でより高い比を示す単離されたバイオマーカーの対ＩＢＰ４／ＳＨＢＧを提供する。

0021

一実施形態では、本発明は、バイオマーカーの対ＩＢＰ４／ＳＨＢＧに対応する代用ペプチドの対を含む組成物であって、バイオマーカーの対が、満期対照と比較して早産リスクのある妊娠女性でより高い比を示す組成物を提供する。一実施形態では、組成物は、代用ペプチドの各々の安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0022

さらなる実施形態では、本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルであって、上記対が各々、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すパネルを提供する。一実施形態では、パネルは、上記バイオマーカーの各々に由来する代用ペプチドの安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0023

さらなる実施形態では、本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルであって、上記対が各々、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すパネルを提供する。一実施形態では、パネルは、上記バイオマーカーの各々に由来する代用ペプチドの安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0024

追加の実施形態では、本発明は、代用ペプチドの少なくとも２対のパネルであり、代用ペプチドの上記対が各々、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応するパネルであって、上記対が各々、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すパネルを提供する。一実施形態では、パネルは、代用ペプチドの各々の安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0025

追加の実施形態では、本発明は、代用ペプチドの少なくとも２対のパネルであり、代用ペプチドの上記対が各々、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応するパネルであって、上記対が各々、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すパネルを提供する。一実施形態では、パネルは、代用ペプチドの各々の安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0026

さらなる実施形態では、本発明は、代用ペプチドの少なくとも２対のパネルであり、代用ペプチドの上記対が各々、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応するパネルであって、上記対の少なくとも１つが、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すパネルを提供する。一実施形態では、組成物は、代用ペプチドの各々の安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0027

さらなる実施形態では、本発明は、代用ペプチドの少なくとも２対のパネルであり、代用ペプチドの上記対が各々、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応するパネルであって、上記対の少なくとも１つが、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すパネルを提供する。一実施形態では、組成物は、代用ペプチドの各々の安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0028

追加の実施形態では、本発明は、代用ペプチドの少なくとも２対のパネルであり、代用ペプチドの上記対が各々、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応するパネルであって、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルから導出される計算スコアが、妊娠女性と満期対照との間で値の変化を示すパネルを提供する。一実施形態では、組成物は、代用ペプチドの各々の安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0029

追加の実施形態では、本発明は、代用ペプチドの少なくとも２対のパネルであり、代用ペプチドの上記対が各々、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応するパネルであって、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルから導出される計算スコアが、妊娠女性と満期対照との間で値の変化を示すパネルを提供する。一実施形態では、組成物は、代用ペプチドの各々の安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0030

一実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の比を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、妊娠女性は、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する。

0031

一実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の比を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、妊娠女性は、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する。一部の実施形態では、上記方法は、生物学的試料を得る初期ステップを含む。一部の実施形態では、上記方法は、バイオマーカーの各々のＳＩＳ代用ペプチドを検出、測定、または定量化することを含む。

0032

一部の実施形態では、妊娠女性の早産確率を決定することは、出産時妊娠期間が既知である早産妊娠および満期妊娠のコホートの群から選択される単離されたバイオマーカーの比を測定することにより確率／リスク指標を形成することを含む初期ステップを包含する。さらなる実施形態では、早産リスク指標は、出産時妊娠期間が記録されている早産妊娠および満期妊娠のコホートでＩＢＰ４／ＳＨＢＧの比を測定することにより形成される。一部の実施形態では、妊娠女性の早産確率を決定することは、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧの比を測定すること、および指標群でＩＢＰ４／ＳＨＢＧを導出したのと同じ単離および測定技法を使用して、その値を指標と比較し、早産リスクを導出することを含む。

0033

一実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、妊娠女性は、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する。一部の実施形態では、上記方法は、生物学的試料を得る初期ステップを含む。一部の実施形態では、上記方法は、バイオマーカーの各々のＳＩＳ代用ペプチドを検出、測定、または定量化することを含む。

0034

一実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、妊娠女性は、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する。一部の実施形態では、上記方法は、生物学的試料を得る初期ステップを含む。一部の実施形態では、上記方法は、バイオマーカーの各々のＳＩＳ代用ペプチドを検出、測定、または定量化することを含む。

0035

別の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルの反転値の変化を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。別の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルの反転値の変化を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、反転値は、妊娠女性と満期対照との間に個々のバイオマーカーの相対強度の変化が存在することを明らかにし、妊娠女性の早産確率を示す。追加の実施形態では、測定ステップは、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、バイオマーカーの代用ペプチドを測定することを含む。一部の実施形態では、妊娠女性は、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する。一部の実施形態では、上記方法は、生物学的試料を得る初期ステップを含む。一部の実施形態では、上記方法は、バイオマーカーの各々のＳＩＳ代用ペプチドを検出、測定、または定量化することを含む。

0036

一実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料の、ＩＢＰ４およびＳＨＢＧからなるバイオマーカーの対の反転値を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、妊娠女性は、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する。一部の実施形態では、上記方法は、生物学的試料を得る初期ステップを含む。一部の実施形態では、上記方法は、バイオマーカーの各々のＳＩＳ代用ペプチドを検出、測定、または定量化することを含む。

0037

一実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＳＨＢＧに対するＩＢＰ４の比（ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ）からなるバイオマーカーの対の反転値を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含み、妊娠女性での比が、満期対照と比較してより高いことが、早産のリスク増加を示す方法を提供する。さらなる実施形態では、妊娠女性は、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する。一部の実施形態では、上記方法は、生物学的試料を得る初期ステップを含む。一部の実施形態では、上記方法は、バイオマーカーの各々のＳＩＳ代用ペプチドを検出、測定、または定量化することを含む。

0038

一実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、バイオマーカー対ＩＢＰ４およびＳＨＢＧの反転値を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、妊娠女性は、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する。一部の実施形態では、上記方法は、生物学的試料を得る初期ステップを含む。一部の実施形態では、上記方法は、バイオマーカーの各々のＳＩＳ代用ペプチドを検出、測定、または定量化することを含む。

0039

本発明はまた、妊娠女性中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対を検出するための方法であって、
ａ．前記妊娠女性から生物学的試料を得るステップ、
ｂ．前記生物学的試料を、前記対の第１のメンバーと特異的に結合する第１の捕捉剤および前記対の第２のメンバーと特異的に結合する第２の捕捉剤と接触させることにより、前記単離されたバイオマーカーの対が、前記生物学的試料中に存在するか否かを検出するステップ、および
前記対の第１のバイオマーカーと前記第１の捕捉剤との結合、および前記対の前記第２のメンバーと前記第２の捕捉剤との結合を検出するステップ
を含む方法を提供する。

0040

一実施形態では、本発明は、妊娠女性中のＩＢＰ４およびＳＨＢＧを検出するための方法であって、ａ．妊娠女性から生物学的試料を得るステップ；ｂ．生物学的試料を、ＩＢＰ４と特異的に結合する捕捉剤およびＳＨＢＧと特異的に結合する捕捉剤と接触させることにより、ＩＢＰ４およびＳＨＢＧが生物学的試料中に存在するか否かを検出するステップ；およびｃ．ＩＢＰ４と捕捉剤との結合およびＳＨＢＧと捕捉剤との結合を検出するステップを含む方法を提供する。一実施形態では、上記方法は、上記バイオマーカーの対の反転値を測定することを含む。さらなる実施形態では、妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することは、妊娠女性の早産確率を示す。一実施形態では、試料は、妊娠期間の１９〜２１週で得られる。さらなる実施形態では、捕捉剤は、抗体、抗体断片、核酸ベースのタンパク結合試薬、低分子、またはそれらの変異体からなる群から選択される。追加の実施形態では、上記方法は、酵素免疫測定法（ＥＩＡ）、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、およびラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）からなる群から選択されるアッセイにより実施される。

0041

本発明はまた、妊娠女性中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対を検出するための方法であって、
ａ．前記妊娠女性から生物学的試料を得るステップ、および
ｂ．前記試料を、質量分析定量化から構成されるプロテオミクスワークフローに供することを含む、前記単離されたバイオマーカーの対が前記生物学的試料中に存在するか否かを検出するステップ
を含む方法を提供する。

0042

一実施形態では、本発明は、妊娠女性中のＩＢＰ４およびＳＨＢＧを検出するための方法であって、
ａ．前記妊娠女性から生物学的試料を得るステップ、および
ｂ．前記試料を、質量分析定量化から構成されるプロテオミクスワークフローに供することを含む、前記単離されたバイオマーカーの対が前記生物学的試料中に存在するか否かを検出するステップ
を含む方法を提供する。

0043

一部の実施形態では、反転値は、妊娠女性と満期対照との間に個々のバイオマーカーの相対強度の変化が存在することを明らかにし、妊娠女性の早産確率を示す。追加の実施形態では、測定ステップは、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、バイオマーカーの代用ペプチドを測定することを含む。一実施形態では、早産リスク指標は、出産時妊娠期間が記録されている早産妊娠および満期妊娠のコホートでＩＢＰ４／ＳＨＢＧの比を測定することにより形成される。その後、臨床業務では、個々の妊娠でのＩＢＰ４／ＳＨＢＧの測定された比を、指標群でＩＢＰ４／ＳＨＢＧを導出したのと同じ単離および測定技法を使用して、指標と比較し、早産リスクを導出する。

0044

本発明の他の特徴および利点が、詳細な説明から、および特許請求の範囲から明らかになるであろう。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対を含む組成物であって、バイオマーカーの前記対が、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示す組成物。
（項目２）
ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの対の、代用ペプチドの対を含む組成物であって、バイオマーカーの前記対が、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示す組成物。
（項目３）
前記代用ペプチドの各々に対応する安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）をさらに含む、項目２に記載の組成物。
（項目４）
ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルであって、バイオマーカーの前記対が各々、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すパネル。
（項目５）
代用ペプチドの少なくとも２対のパネルであり、代用ペプチドの前記対が各々、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応するパネルであって、バイオマーカーの前記対が各々、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すパネル。
（項目６）
前記代用ペプチドの各々に対応するＳＩＳペプチドをさらに含む、項目５に記載のパネル。
（項目７）
妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、前記妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定して、前記妊娠女性の前記早産確率を決定することを含む方法。
（項目８）
妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、前記妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルの反転値の変化を測定して、前記妊娠女性の前記早産確率を決定することを含む方法。
（項目９）
前記妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することが、前記妊娠女性の前記早産確率を示す、項目７または８に記載の方法。
（項目１０）
前記測定が、前記妊娠女性から得られた前記生物学的試料中の前記バイオマーカーの代用ペプチドを測定することを含む、項目７または８に記載の方法。
（項目１１）
前記測定が、前記代用ペプチドの各々の安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を測定することをさらに含む、項目１０に記載の方法。
（項目１２）
前記確率が、リスクスコアとして表される、項目７または８に記載の方法。
（項目１３）
前記生物学的試料が、全血、血漿、および血清からなる群から選択される、項目７または８に記載の方法。
（項目１４）
前記生物学的試料が血清である、項目７または８に記載の方法。
（項目１５）
前記試料が、妊娠期間の１９〜２１週で得られる、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記測定が、質量分析法（ＭＳ）を含む、項目７または８に記載の方法。
（項目１７）
前記測定が、捕捉剤を使用するアッセイを含む、項目７または８に記載の方法。
（項目１８）
前記捕捉剤が、抗体、抗体断片、核酸ベースのタンパク結合試薬、低分子、またはそれらの変異体からなる群から選択される、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
前記アッセイが、酵素免疫測定法（ＥＩＡ）、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、およびラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）からなる群から選択される、項目１７に記載の方法。
（項目２０）
１つまたは複数のリスク兆候の測定可能な特徴を検出する初期ステップをさらに含む、項目７または８に記載の方法。
（項目２１）
前記リスク兆候が、体格指標（ＢＭＩ）、妊娠回数、および胎児性別からなる群から選択される、項目１７に記載の方法。
（項目２２）
前記リスク兆候がＢＭＩである、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記早産確率の前記決定前に、出産時妊娠期間（ＧＡＢ）を予測することをさらに含む、項目７または８に記載の方法。
（項目２４）
前記妊娠女性が、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する、項目２２に記載の方法。
（項目２５）
妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、前記妊娠女性から得られた生物学的試料中の、表２６に列挙されているバイオマーカーから選択される、バイオマーカーの対の反転値を測定して、前記妊娠女性の前記早産確率を決定することを含む方法。
（項目２６）
妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、前記妊娠女性から得られた生物学的試料中の、バイオマーカーの対ＩＢＰ４およびＳＨＢＧの反転値を測定して、前記妊娠女性の前記早産確率を決定することを含む方法。
（項目２７）
前記妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することが、前記妊娠女性の前記早産確率を示す、項目２５または２６に記載の方法。
（項目２８）
前記測定が、前記妊娠女性から得られた前記生物学的試料中の前記バイオマーカーの代用ペプチドを測定することを含む、項目２５または２６に記載の方法。
（項目２９）
前記確率が、リスクスコアとして表される、項目２５または２６に記載の方法。
（項目３０）
前記生物学的試料が、全血、血漿、および血清からなる群から選択される、項目２５または２６に記載の方法。
（項目３１）
前記生物学的試料が血清である、項目２５または２６に記載の方法。
（項目３２）
前記試料が、妊娠期間の１９〜２２週で得られる、項目３０に記載の方法。
（項目３３）
前記測定が、質量分析法（ＭＳ）を含む、項目２５または２６に記載の方法。
（項目３４）
前記測定が、捕捉剤を使用するアッセイを含む、項目２５または２６に記載の方法。
（項目３５）
前記捕捉剤が、抗体、抗体断片、核酸ベースのタンパク結合試薬、低分子、またはそれらの変異体からなる群から選択される、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
前記アッセイが、酵素免疫測定法（ＥＩＡ）、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、およびラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）からなる群から選択される、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
１つまたは複数のリスク兆候の測定可能な特徴を検出することをさらに含む、項目２５または２６に記載の方法。
（項目３８）
前記リスク兆候が、体格指標（ＢＭＩ）、妊娠回数、および胎児性別からなる群から選択される、項目３７に記載の方法。
（項目３９）
前記リスク兆候がＢＭＩである、項目３８に記載の方法。
（項目４０）
前記早産確率の前記決定前に、出産時妊娠期間（ＧＡＢ）を予測することをさらに含む、項目２５または２６に記載の方法。
（項目４１）
前記妊娠女性が、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する、項目３９に記載の方法。
（項目４２）
前記反転値が、前記妊娠女性中の前記早産確率を決定するために、前記ＳＨＢＧに対する前記ＩＢＰ４の比（ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ）に基づいており、満期対照と比較して妊娠女性での比がより高いことが、早産リスクの増加を示す、項目２６に記載の方法。
（項目４３）
妊娠女性中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対を検出するための方法であって、
ａ．前記妊娠女性から生物学的試料を得ること、
ｂ．前記生物学的試料を、前記対の第１のメンバーと特異的に結合する第１の捕捉剤および前記対の第２のメンバーと特異的に結合する第２の捕捉剤と接触させることにより、前記単離されたバイオマーカーの対が、前記生物学的試料中に存在するか否かを検出すること、および
ｃ．前記対の第１のバイオマーカーと前記第１の捕捉剤との結合、および前記対の前記第２のメンバーと前記第２の捕捉剤との結合を検出すること
を含む方法。
（項目４４）
バイオマーカーの前記対の反転値を測定することをさらに含む、項目４３に記載の方法。
（項目４５）
前記妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することが、前記妊娠女性の前記早産確率を示す、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
前記確率が、リスクスコアとして表される、項目４５に記載の方法。
（項目４７）
前記生物学的試料が、全血、血漿、および血清からなる群から選択される、項目４３に記載の方法。
（項目４８）
前記生物学的試料が血清である、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
前記試料が、妊娠期間の１９〜２１週で得られる、項目４７に記載の方法。
（項目５０）
前記捕捉剤が、抗体、抗体断片、核酸ベースのタンパク結合試薬、低分子、またはそれらの変異体からなる群から選択される、項目４３に記載の方法。
（項目５１）
酵素免疫測定法（ＥＩＡ）、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、およびラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）からなる群から選択されるアッセイにより実施される、項目４３に記載の方法。
（項目５２）
１つまたは複数のリスク兆候の測定可能な特徴を検出することをさらに含む、項目４４に記載の方法。
（項目５３）
前記リスク兆候が、体格指標（ＢＭＩ）、妊娠回数、および胎児性別からなる群から選択される、項目５２に記載の方法。
（項目５４）
前記リスク兆候がＢＭＩである、項目５３に記載の方法。
（項目５５）
前記妊娠女性が、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する、項目５４に記載の方法。
（項目５６）
前記単離されたバイオマーカーの対がＩＢＰ４／ＳＨＢＧである、項目４３に記載の方法。
（項目５７）
妊娠女性中のＩＢＰ４およびＳＨＢＧを検出するための方法であって、
ａ．前記妊娠女性から生物学的試料を得ること、
ｂ．前記生物学的試料を、ＩＢＰ４と特異的に結合する捕捉剤およびＳＨＢＧと特異的に結合する捕捉剤と接触させることにより、前記ＩＢＰ４およびＳＨＢＧが、前記生物学的試料中に存在するか否かを検出すること、および
ｃ．ＩＢＰ４と前記捕捉剤との結合、およびＳＨＢＧと前記捕捉剤との結合を検出すること
を含む方法。
（項目５８）
妊娠女性中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＩＢＰ４／ＰＳＧ３、ＩＢＰ４／ＬＹＡＭ１、ＩＢＰ４／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＩＢＰ３、ＣＬＵＳ／ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ／ＬＹＡＭ１、ＩＮＨＢＣ／ＰＳＧ３、ＩＮＨＢＣ／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＳＧ２／ＩＧＦ２、ＰＳＧ２／ＬＹＡＭ１、ＰＥＤＦ／ＰＳＧ３、ＰＥＤＦ／ＳＨＢＧ、ＰＥＤＦ／ＬＹＡＭ１、ＣＤ１４／ＬＹＡＭ１、およびＡＰＯＣ３／ＬＹＡＭ１からなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対を検出するための方法であって、
ａ．前記妊娠女性から生物学的試料を得ること、および
ｂ．前記試料を、質量分析定量化から構成されるプロテオミクスワークフローに供することを含む、前記単離されたバイオマーカーの対が前記生物学的試料中に存在するか否かを検出すること
を含む方法。
（項目５９）
妊娠女性中のＩＢＰ４およびＳＨＢＧを検出するための方法であって、
ａ．前記妊娠女性から生物学的試料を得ること、および
ｂ．前記試料を、質量分析定量化から構成されるプロテオミクスワークフローに供することを含む、前記ＩＢＰ４およびＳＨＢＧが前記生物学的試料中に存在するか否かを検出すること
を含む方法。
（項目６０）
バイオマーカーの前記対の反転値を測定することをさらに含む、項目５８または５９に記載の方法。
（項目６１）
前記妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することが、前記妊娠女性の前記早産確率を示す、項目６０に記載の方法。
（項目６２）
前記確率が、リスクスコアとして表される、項目６１に記載の方法。
（項目６３）
前記生物学的試料が、全血、血漿、および血清からなる群から選択される、項目５８または５９に記載の方法。
（項目６４）
前記生物学的試料が血清である、項目６３に記載の方法。
（項目６５）
前記試料が、妊娠期間の１９〜２１週で得られる、項目６３に記載の方法。
（項目６６）
前記プロテオミクスのワークフローが、ＳＩＳペプチドを定量化することを含む、項目５８または５９に記載の方法。
（項目６７）
１つまたは複数のリスク兆候の測定可能な特徴を検出することをさらに含む、項目５８または５９に記載の方法。
（項目６８）
前記リスク兆候が、体格指標（ＢＭＩ）、妊娠回数、および胎児性別からなる群から選択される、項目６７に記載の方法。
（項目６９）
前記リスク兆候が体格指数（ＢＭＩ）である、項目６８に記載の方法。
（項目７０）
前記妊娠女性が、２２ｋｇ／ｍ２超および３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満の体格指数（ＢＭＩ）を有する、項目６９に記載の方法。

0045

血液採取ウィンドウ。個々の反転性能が、血液採取ウィンドウ全体にわたって示されている。示されている反転：ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ；ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ；ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ；ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ；ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ；ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ；ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４；ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４；ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ；ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３；ＨＥＭＯ／ＩＢＰ６；ＨＥＭＯ／ＰＴＧＤＳ。

0046

ＧＡＢＤの発見症例、裏付け症例、および検証症例。

0047

妊娠中のタンパク質発現。種々のタンパク質は、公知のタンパク質挙動、および早産の影響を受けないタンパク質／経路を知ることに基づいて分析することができる。図３は、妊娠中の妊娠関連タンパク質の発現を示す。こうしたタンパク質とそれらのネットワークは、示されている妊娠期間では早産病理の影響を受けていない。

0048

妊娠中のタンパク質発現。図４は、胎盤特異的成長ホルモンに関する、図３に示されているグラフの拡大版を示す。

0049

妊娠中のタンパク質病理。インスリン様成長因子結合タンパク質４（ＩＢＰ４）は、血液採取ウィンドウ１９〜２１週では、少なくとも１０％過剰発現されていた。性ホルモン結合グロブリン（ＳＨＢＧ）は、血液採取ウィンドウ１９〜２１週では、少なくとも１０％過少発現されていた。

0050

裏付け選択基準。図６には、臨床的におよび分析的にロバストな高性能の早産検査を実施するための基準が記載されている。

0051

モンテカルロ相互検証（ＭＣＶＶ）。ＭＣＣＶは、分類器（ｃｌａｓｓｉｆｉｅｒ）が、同じ集団から採取された独立サンプルセットでどの程度良好な性能を示すかを推定する保守的な方法である（例えば、ＰＡＰＲ）。

0052

［ＩＢＰ４］／［ＳＨＢＧ ＣＨＬ１ ＣＬＵＳ］の分析。ＣＨＬ１およびＣＬＵＳは、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧのみに対して０．０３だけ性能を増加させた。

0053

検出力および標本サイズ分析。検出力および標本サイズ分析は、研究が、標本数および性能推定の閾値において帰無仮説（ＡＵＣ＝０．５）を棄却するための十分な検出力があるかどうかの可能性を予測する。

0054

妊娠時計および出産までの時間。妊娠中に増加するが、ＰＴＢ症例および対照では違いがない複数の分析物を使用して、妊娠日数を生化学的に決定することができる。生化学日数決定は、最終月経の日付による日数決定または超音波日数決定の確認に、または後にｓＰＴＢリスク、ＴＴＢ、もしくはＧＡＢ予測を決定する前に有用であり得る。

0055

分類器開発。図１１は、分類器を開発するための基準を示す。

0056

発見アッセイでの経路網羅範囲。図１２は、経路毎のタンパク質の分布を示す。

0057

発見データのＰＣＡは、血液採取ウィンドウ全体にわたって変更を検出し、したがってこの高度多重アッセイが妊娠期間に感受性であることを示す。

0058

発見試料中で測定されたタンパク質の階層的クラスタリング。

0059

より大きなクラスター内の胎盤特異的タンパク質ブランチ。右パネルには、Ｔｈｏｍｐｓｏｎにより特定された、妊娠中に発現される遺伝子のモジュールが列挙されており、左のパネルには、発見血清プロテオミクスアッセイが、このモジュールの関連発現を再現することが示されている（Thompsonら、Genome Res.、１２巻（１０号）：１５１７〜１５２２頁（２００２年））。

0060

調節異常タンパク質ＰｒｅＴＲＭ（商標）試料。

0061

強調された性ホルモン結合グロブリン（ＳＨＧＢ）生物学。ＳＨＢＧは、胎盤細胞で発現される（右）。ＳＨＢＧは、胎盤胎児区画における遊離テストステロンおよびエストロゲンレベルのレベルを制御することに関与する場合がある（左）。

0062

ＩＢＰ４、ＩＧＦ２、ＰＡＰＰ−Ａ、およびＰＲＧ２の相互作用。ＩＢＰ４は、ＩＧＦ２の負の制御因子である。ＩＢＰ４は、ＰＡＰＰＡ媒介性タンパク質分解によりＩＧＦ２から放出される。低レベルのＰＡＰＰＡは、ＩＵＧＲおよびＰＥに関与するとされている。高レベルのＩＢＰ４は、ＩＧＦ２の活性抑制を示す。ＰＴＢ症例は、ＰＡＰＰＡ、ＰＲＧ２のレベルを抑制し、ＩＢＰ４のレベルを上昇させる。

0063

インスリン様成長因子結合タンパク質４（ＩＢＰ４）。ＩＢＰ４は、ＰＴＢ症例では上方制御される。ＩＧＦ２は、妊娠初期ではＥＶＴの増殖、分化、および侵入を刺激する。ＩＧＦ活性は、正常な胎盤形成および胎児成長に不可欠である。ＩＢＰ４は、母体−胎児インターフェースでのＩＧＦ２活性の自己分泌および傍分泌制御を媒介する。細胞栄養芽層により発現されるＩＧＦ２の活性は、脱落膜細胞により生成されるＩＢＰによりバランスが保たれる。妊娠１期でのＩＢＰ４上昇およびＩＧＦ２低下は、胎盤機能不全と相関した（例えば、ＩＵＧＲ／ＳＧＡ）。

0064

ＩＢＰ４、ＳＨＢＧ、およびＣＨＬ１についてのＭＳ対ＥＬＩＳＡ相関性。主要分析物の質量分析およびＥＬＩＳＡは、良好な一致を示した。２つの直交性プラットフォームで一致が得られることにより、分析物測定の信頼性が保証される。

0065

１９〜２１週のＧＡＢＤからの発見試料中のＩＢＰ４／ＳＨＢＧによるＰＴＢ分類。妊娠１９〜２１週の発見試料をＢＭＩの高低により分類した。ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ反転値は、ＳＨＢＧ値がより低かったため、高ＢＭＩカテゴリーでより高い。症例および対照の分離は、より低いＢＭＩでより大きい。

0066

低ＢＭＩのＰＴＢ症例でのＳＨＢＧレベル抑制。ＧＡＢＤ全体にわたるＰＡＰＲ対象のＳＨＢＧ血清レベルの線形フィッティング。ＳＨＢＧレベルは、高ＢＭＩにより抑制される。ＳＨＢＧレベルは、妊娠全体にわたって増加する。低ＢＭＩのＰＴＢ症例は、妊娠全体にわたって加速度的に増加するＳＨＢＧレベルを低下させた。

0067

図２３には、ＰＡＰＲの研究対象の分布が要約されている。

0068

図２４は、ＢＭＩ階層化検証試料セットを分類するための、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ予測因子を使用したＲＯＣ曲線および対応するＡＵＣ値を示す。

0069

図２５は、予測因子スコアの関数としての、臨床リスクの尺度である有病率調整陽性予測値（ＰＰＶ）を示す。予測因子スコアとＰＰＶとの間に関連性があることが計算されることにより、任意の未知対象のｓＰＴＢリスクの確率を決定することが可能になる。リスク曲線グラフ下の最上部（紫色）の直線は、＜３５ ０／７週のＧＡＢに対応し、最上部から２番目の直線（赤色）は、３５ ０／７〜３７ ０／７／週のＧＡＢに対応し、３番目の直線（緑色）は、３７ ０／７〜３９ ０／７／週のＧＡＢに対応し、最上部から４番目の直線（青色）は、３９ ０／７週≦ＧＡＢのＧＡＢに対応する。

0070

図２６は、カプランマイヤー分析での事象としての高リスク群および低リスク群の出産割合を表示する。高リスクおよび低リスクは、図２５のデータによるｓＰＴＢの平均集団リスク（＝１４．６％）の２倍超またはそれ未満の相対リスクと定義した。

0071

図２７は、至適ＢＭＩおよびＧＡ区間内での盲検裏付けおよび検証分析からの対象の組合せを使用した、予測因子性能に対応するＲＯＣ曲線を示す。組合せ試料のＲＯＣ曲線は、０．７２のＡＵＲＯＣに対応する（ｐ＝０．０１３）。

0072

図２８は、４４個のタンパク質が、重複する３週ＧＡ区間で上方または下方のいずれかで制御され、分析フィルターを通過したことを示す。

0073

図２９は、全体的な上位高性能反転ＩＢＰ４／ＳＨＢＧが、１９ ０／７から２１ ６／７までの区間では、ＡＵＲＯＣ＝０．７４を有したことを示す。

0074

図３０は、２，０００回のブートストラップ反復から得られた平均ＡＵＲＯＣが０．７６だったことを示す。裏付け試料の盲検ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ ＡＵＲＯＣ性能は、全対象およびＢＭＩ階層化対象で、それぞれ０．７７および０．７９だった。これは、発見で得られた性能と良好な一致を示した。盲検裏付けの後、発見および裏付け試料を、ブートストラップ性能決定のために組み合わせた。

0075

図３１は、ＭＳ対ＥＬＩＳＡスコア値により導出されたｓＰＴＢ症例対対照の分離を示す。

0076

図３２は、ＢＭＩを限定しないイムノアッセイ対ＭＳ ＲＯＣ分析を示す。

0077

図３３は、ＢＭＩが２２よりも大きく、３７未満または３７と等しい場合の、イムノアッセイ対ＭＳ ＲＯＣ分析を示す。

0078

図３４は、ＢＭＩ階層化対象（左パネル）および全対象（右パネル）の、ＭＳおよびＥＬＩＳＡで導出したＧＡＢＤ１３３〜１４６内のＩＢＰ４／ＳＨＢＧスコア値間の相関性を示す。

0079

図３５は、対照および症例（ＢＭＩ階層化）のＥＬＩＳＡおよびＭＳ分離を示す。

0080

図３６は、対照および症例（全ＢＭＩ）のＥｌｉｓａおよびＭＳ分離を示す。

0081

図３７は、Ａｂｂｏｔｔ社製ＡｒｃｈｉｔｅｃｔＣＭＩＡ、半自動イムノアッセイ機を用いた、ならびに試料の免疫枯渇、酵素消化、およびＡｇｉｌｅｎｔ６４９０質量分析計での分析を含むＳｅｒａ Ｐｒｏｇｎｏｓｔｉｃｓのプロテオミクス分析法によるＳＨＢＧ測定値の比較を示す。

0082

図３８は、Ｒｏｃｈｅ社製ｃｏｂａｓ ｅ６０２分析機、半自動イムノアッセイ機を用いた、ならびに試料の免疫枯渇、酵素消化、およびＡｇｉｌｅｎｔ６４９０質量分析計での分析を含むＳｅｒａ Ｐｒｏｇｎｏｓｔｉｃｓのプロテオミクス分析法によるＳＨＢＧ測定値の比較を示す。

0083

図３９は、Ａｂｂｏｔｔ社製ＡｒｃｈｉｔｅｃｔＣＭＩＡおよびＲｏｃｈｅ社製ｃｏｂａｓ ｅ６０２分析機、両半自動イムノアッセイ機によるＳＨＢＧ測定値の比較を示す。

0084

図４０は、ＩＢＰ４タンパク質の最長アイソフォームのドメインおよび構造特徴を示す（Ｕｎｉｐｒｏｔ：Ｐ２２６９２）。ＩＢＰ４ＱＣＨＰＡＬＤＧＱＲ（ａａ、２１４〜２２３）ペプチドは、チログロブリン１型ドメイン内に位置する。ＩＢＰ４は、残基１２５に単一のＮ連結グリコシル化部位を有する。

0085

図４１は、２つのＩＢＰ４アイソフォームのＱＣＨＰＡＬＤＧＱＲペプチドの位置を強調して示す。

0086

図４２は、ＳＨＢＧタンパク質の最長アイソフォームのドメインおよび構造特徴を示す（Ｕｎｉｐｒｏｔ：Ｐ０４２７８）。ＳＨＢＧ ＩＡＬＧＧＬＬＦＰＡＳＮＬＲ（ａａ、１７０〜１８３）ペプチドは、最初のラミンＧ様ドメインに位置する。ＳＨＢＧは、３つのグリコシル化部位を有する；残基３８０および３９６の２つのＮ連結部位；残基３６の１つのＯ連結部位である。

0087

図４３は、ＳＨＢＧの７つのアイソフォーム内のエキソン４のＩＡＬＧＧＬＬＦＰＡＳＮＬＲペプチドの位置を強調して示す。

0088

図４４は、血液採取時妊娠期間（ＧＡＢＤ）全体にわたるｓＰＴＢ症例および満期対照のＩＢＰ４レベルの平均応答比を別々に示す。横断的発見データは、１０日間のウィンドウをスライドさせて平滑化することにより分析した。症例対対照シグナルは、およそ最大１０％差異に相当する。

0089

図４５は、血液採取時妊娠期間（ＧＡＢＤ）全体にわたるｓＰＴＢ症例および満期対照のＳＨＢＧレベルの平均応答比を別々に示す。横断的発見データは、１０日間のウィンドウをスライドさせて平滑化することにより分析した。症例対対照シグナルは、およそ最大１０％差異に相当する。

0090

図４６は、血液採取時妊娠期間（ＧＡＢＤ）全体にわたるｓＰＴＢ症例および満期対照のＩＢＰ４／ＳＨＢＧ予測因子スコアを別々に示す。横断的発見データは、１０日間のウィンドウをスライドさせて平滑化することにより分析した。２つの曲線間の最大差異は、個々の分析物のシグナルのおよそ１０％の差異と比較して、ほぼ２０％の差異に相当する（図４５および図４６）。これらデータは、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ反転戦略を使用することにより、得られる診断シグナルが増幅されることを示す。

0091

図４７は、多数の異なる反転の形成の結果としての診断シグナルの増幅を示す。反転の形成による診断シグナルの増幅が一般的なものか否かを調査するため、本発明者らは、ＲＯＣ分析により多数の異なるタンパク質で形成される反転の診断性能を検討した。妊娠１９／０週〜２１／６週で収集された試料に由来するデータセットを使用したＡＵＣ値（ｓＰＴＢ症例対満期対照）の範囲が上段パネルに示されている。隣接するボックスプロットは、関連する反転を形成するために使用された個々の上方制御および下方制御されたタンパク質のＲＯＣ性能の範囲を示す。同様に、下段パネルは、反転のウィルコクソン検定（ｓＰＴＢ症例対満期対照）から導出されたｐ値が、対応する個々のタンパク質のものよりも有意であることを示す。

0092

図４８は、個々のＩＢＰ４およびＳＨＢＧ応答比の測定値および対応する反転スコア計算値の分析的変動係数（ＣＶ）を示す。生物学的な変動性のない妊娠ドナーに由来するプールした対照血清試料（ｐＨＧＳ）を、複数のバッチで数日にわたって分析した。反転変動性は、個々のタンパク質で変動性未満である。これらデータは、試料の実験室処理中に生じる分析変動性の反転対照の形成を示す。分析的変動性は、生物学的な現象ではない。

0093

図４９は、多数の反転およびそれらの個々の上方および下方制御されたタンパク質の分析的ＣＶを示す。反転の形成による診断シグナルの増幅が一般的なものか否かを調査するために、本発明者らは、多数のタンパク質の比により形成された高性能の反転（ＡＵＣ＞０．６）のＲＯＣ性能（ＡＵＣ）を検討した。妊娠１９／０週〜２１／６週で収集された試料に由来するデータセットを使用したＡＵＣ値（ｓＰＴＢ症例対満期対照）の範囲が上段パネルに示されている。隣接するボックスプロットは、関連する反転を形成するために使用された個々の上方制御および下方制御されたタンパク質のＲＯＣ性能の範囲を示す。同様に、反転のウィルコクソン検定（ｓＰＴＢ症例対満期対照）から導出されたｐ値は、対応する個々のタンパク質のものよりも有意である。

0094

図５０は、他の徴候と比較した、子癇前症であると医学的に示されたと注釈されている対象のＰｒｅＴＲＭ（商標）スコア比較を示す。

0095

図５１は、検証試料セット（ＢＭＩ>２２<＝３７）のＩＢＰ４／ＳＨＢＧ予測因子性能のメトリックの表を示す。異なる境界を使用して対照（カットオフ超）から症例（カットオフ未満）を規定するため、予測因子感度、特異性、ＲＯＣ曲線下面積（ＡＵＣ）、およびオッズ比を決定した。

0096

図５２は、糖尿病注釈での反転強度ヒートマップを示す。赤色の矢印は糖尿病症例を示す。試料は、下部に列挙されており、スクリーンの右側がＰＴＢ症例であり、左側が満期出産である。糖尿病患者は、右側にクラスター化されており、妊娠糖尿病を予測するためのバイオマーカーから診断検査を構築することが可能であることを示す。

0097

図５３は、分析物応答比の階層的クラスタリングを示す。

0098

図５４は、細胞外マトリックス相互作用で機能する発現の異なるタンパク質を示す。

0099

図５５は、１８週で最大の分離を示す、ＩＧＦ−２経路で機能する発現の異なるタンパク質の動態プロットを示す。

0100

図５６Ａは、ｓＰＴＢにおける、これらタンパク質の生物学的利用能に影響を及ぼすＩＧＦ−２、ＩＢＰ４、ＰＡＰＰ１、およびＰＲＧ２タンパク質間の相互作用の模式図を示す。図５６Ｂは、ＩＲ−Ｂに結合するインスリンにより、ならびにＩＲ−ＡまたはＩＧＦ１Ｒのいずれかに結合するインスリンおよびＩＧＦにより、優先的に活性化される細胞内シグナルの模式図を示す。

0101

図５７は、代謝ホルモンバランスに関する機能を有する、発現の異なるタンパク質の動態プロットを示す。

0102

図５８は、血管新生に関する機能を有する、発現の異なるタンパク質の動態プロットを示す。

0103

図５９は、自然免疫に関する機能を有する、発現の異なるタンパク質の動態プロットを示す。

0104

図６０は、凝固に関する機能を有する、発現の異なるタンパク質の動態プロットを示す。

0105

図６１は、発現の異なる血清／分泌タンパク質の動態プロットを示す。

0106

図６２は、発現の異なるＰＳＧ／ＩＢＰの動態プロットを示す。

0107

図６３は、発現の異なるＥＣＭ／細胞表面タンパク質の動態プロットを示す。

0108

図６４は、発現の異なる補体／急性期タンパク質−１の動態プロットを示す。

0109

図６５は、発現の異なる補体／急性期タンパク質−２の動態プロットを示す。

0110

図６６は、発現の異なる補体／急性期タンパク質−３の動態プロットを示す。

0111

図６７は、発現の異なる補体／急性期タンパク質−４の動態プロットを示す。

0112

図６８は、１７週０日から２８週６日までの血液採取時妊娠期間（ＧＡＢＤ）のデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0113

図６９は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0114

図７０は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0115

図７１は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0116

図７２は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0117

図７３は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0118

図７４は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0119

図７５は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0120

図７６は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0121

図７７は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0122

図７８は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0123

図７９は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0124

図８０は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0125

図８１は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0126

図８２は、１７週０日から２８週６日までのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0127

図８３は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0128

図８４は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｉに指定されている分析物の動態プロットを示す。

0129

図８５は、１７週０日から２８週６日までのＧＡＢＤのデータを用いた、パネルＡ〜Ｇに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0130

図８６は、＜３７ ０／７週対＞＝３７ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0131

図８７は、＜３７ ０／７週対＞＝３７ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0132

図８８は、＜３７ ０／７週対＞＝３７ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0133

図８９は、＜３７ ０／７週対＞＝３７ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0134

図９０は、＜３７ ０／７週対＞＝３７ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0135

図９１は、＜３７ ０／７週対＞＝３７ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0136

図９２は、＜３７ ０／７週対＞＝３７ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0137

図９３は、＜３７ ０／７週対＞＝３７ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0138

図９４は、＜３７ ０／７週対＞＝３７ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0139

図９５は、＜３７ ０／７週対＞＝３７ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｃに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0140

図９６は、＜３５ ０／７週対＞＝３５ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0141

図９７は、＜３５ ０／７週対＞＝３５ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0142

図９８は、＜３５ ０／７週対＞＝３５ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0143

図９９は、＜３５ ０／７週対＞＝３５ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0144

図１００は、＜３５ ０／７週対＞＝３５ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0145

図１０１は、＜３５ ０／７週対＞＝３５ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0146

図１０２は、＜３５ ０／７週対＞＝３５ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0147

図１０３は、＜３５ ０／７週対＞＝３５ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0148

図１０４は、＜３５ ０／７週対＞＝３５ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｉに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0149

図１０５は、＜３５ ０／７週対＞＝３５ ０／７週の出産時妊娠期間カットオフを使用した、パネルＡ〜Ｃに指定されているペプチドトランジションの動態プロットを示す。

0150

図１０６は、ｓＰＴＢ症例および対照のＩＢＰ４およびＳＨＢＧレベルならびにＩＢＰ４／ＳＨＢＧ反転値を別々に示す。

0151

図１０７は、市販ＥＬＩＳＡキットおよびＭＳ−ＭＲＭによるＭＳＤ結果の相関性を示す。

0152

図１０８は、ＰＰＲＯＭを伴わない１９〜２０週の早期陣痛（ＰＴＬ）で良好な性能を有する反転の例を示すボックスプロットを提供する。

0153

図１０９は、１９〜２０週の予定日前の早期破水（ＰＰＲＯＭ）で良好な性能を有する反転の例を示すボックスプロットを提供する。
図１０９は、１９〜２０週の予定日前の早期破水（ＰＰＲＯＭ）で良好な性能を有する反転の例を示すボックスプロットを提供する。

0154

図１１０は、＜３７ ０／７妊娠週対＞＝３７ ０／７妊娠週のカットオフを使用した、ｓＰＴＢの予測因子スコア（ｌｎ ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ）と有病率調整相対リスク（陽性予測値）との関係性を示すリスク曲線である。リスク曲線グラフ下の最上部の直線（紫色）は、ｓＰＴＢ（ＧＡＢ＜３５週）に対応し、最上部から２番目の直線（赤色）は、ｓＰＴＢ（３５≦ＧＡＢ＜３７週）に対応し、３番目の直線（緑色）は、ＴＥＲＭ（３７≦ＧＡＢ＜３９週）に対応し、最上部から４番目の直線（青色）は、ＴＥＲＭ（３９週≦ＧＡＢ）に対応する。

0155

図１１１は、＜３５ ０／７妊娠週対＞＝３５ ０／７妊娠週のカットオフを使用した、ｓＰＴＢの予測因子スコア（ｌｎ ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ）と有病率調整相対リスク（陽性予測値）との関係性を示すリスク曲線である。リスク曲線グラフ下の最上部の直線（紫色）は、ｓＰＴＢ（ＧＡＢ＜３５週）に対応し、最上部から２番目の直線（赤色）は、ｓＰＴＢ（３５≦ＧＡＢ＜３７週）に対応し、３番目の直線（緑色）は、ＴＥＲＭ（３７≦ＧＡＢ＜３９週）に対応し、最上部から４番目の直線（青色）は、ＴＥＲＭ（３９週≦ＧＡＢ）に対応する。

0156

（詳細な説明）
本開示は、概して、妊娠女性から得られた生物学的試料中のあるタンパク質およびペプチドが、対照と比べて早産のリスク増加を示す妊娠女性では発現が異なるという発見に基づく。本開示は、さらに特に、本明細書で開示されているバイオマーカーの対の反転値を、妊娠女性の早産確率を高感度および高特異性で決定するための方法に使用することができるという予期しない発見に部分的に基づく。成分比および／または反転対として本明細書中で開示されているタンパク質およびペプチドは、個々に、比で、反転対で、またはバイオマーカー／反転対のパネルのいずれかにより、試験試料を分類するための、早産確率を予測するための、満期出産の確率を予測するための、出産時妊娠期間（ＧＡＢ）を予測するための、出産までの時間（ＴＴＢ）を予測するための、および／またはＰＴＢリスクのある妊娠女性の予防療法の進行をモニタリングするためのバイオマーカーとしての役割を果たす。反転値は、下方制御されたバイオマーカーの相対的ピーク面積に対する上方制御されたバイオマーカーの相対的ピーク面積の比であり、変動性の標準化および診断シグナル増幅の両方の役割を果たす。本発明は、部分的には、一緒に対にすると、反転値に基づいて早産確率を予測することができる特定のバイオマーカーの選択にある。したがって、本発明の根底にあるのは、新規性のある反転にて対にすると有益な情報をもたらす特定のバイオマーカーの選択におけるヒトの独創性である。

0157

用語「反転値」は、下方制御された分析物の相対的ピーク面積に対する上方制御された分析物の相対的ピーク面積の比を指し、変動性の標準化および診断シグナル増幅の両方の役割を果たす。狭域ウィンドウ内のあらゆる考え得る反転の中から、個々の単変量性能に基づいてサブセットを選択することができる。本明細書に開示されているように、本明細書では反転値と呼ばれる、下方制御されたバイオマーカーの相対的ピーク面積に対する上方制御されたバイオマーカーの相対的ピーク面積の比を使用して、ロバストで正確な分類器（ｃｌａｓｓｉｆｉｅｒ）を特定し、早産確率を予測し、満期出産の確率を予測し、出産時妊娠期間（ＧＡＢ）を予測し、出産までの時間を予測し、および／または妊娠女性の予防療法の進行をモニタリングすることができる。したがって、本発明は、部分的には、ＰＴＢと非ＰＴＢとの間で反転値の変化を示す、バイオマーカー対の相対的発現が反転するバイオマーカー対を特定することに基づく。本明細書で開示されている方法でバイオマーカーの比を使用することにより、妊娠女性から生物学的試料を取り出した後の人為的操作の結果である変動性が補正させる。そのような変動性は、例えば、試料に存在するバイオマーカーの測定に使用される方法の試料収集中、処理中、枯渇中、消化中、または任意の他のステップで導入される可能性があり、バイオマーカーが自然界においてどのように挙動するかとは無関係である。したがって、本発明は、概して、変動性を低減するための、および／または診断シグナルを増幅、標準化、もしくは明瞭化するための、診断または予後の方法における反転対の使用を包含する。

0158

用語「反転値」は、下方制御された分析物の相対的ピーク面積に対する上方制御された分析物の相対的ピーク面積の比を指し、変動性の標準化および診断シグナル増幅の両方の役割を果たすが、本発明のバイオマーカーの対は、任意の他の手段、例えば相対的ピーク面積の減算、加算、または乗算により測定することができることも企図される。本明細書で開示されている方法は、そのような他の手段によるバイオマーカー対の測定を包含する。

0159

本方法は、データ標準化に依存せず、過剰フィッティングの回避を支援し、診療所で簡単に実施される非常に単純な実験検査をもたらす、考え得る最も単純な分類器を提供するため有利である。データ標準化に依存しない反転値の変化に基づくマーカー対の使用は、本明細書で開示されている臨床関連バイオマーカーの開発を可能にした。任意の単一のタンパク質の定量化は、測定変動性、通常の流動性、および基線発現の個々の関連するばらつきにより引き起こされる不確実性の影響下にあるため、協調的および系統的な調節下にあり得るマーカーの対を特定することにより、個別化された診断および予後のロバストな方法が可能になる。

0160

本開示は、妊娠女性の早産確率を決定するためのバイオマーカー反転対および反転対の関連パネル、方法、およびキットを提供する。本開示の１つの主要な利点は、早産の発症リスクを妊娠初期に評価することができることであり、早期出産を防止するための適当なモニタリングおよび臨床管理を適宜開始することができる。本発明は、早産についての任意のリスク因子を欠いており、本来ならば、特定および処置されない女性に特に有益である。

0161

例として、本開示は、早産を予測する反転値の変化を示すことが特定されたバイオマーカー対の相対的発現に関する定量データを少なくとも含む、試料に関連するデータセットを得ること、およびこのデータセットを、データセットを使用して妊娠女性の早産確率を決定するのに有用な結果を生成する分析プロセスに入力することにより、妊娠女性の早産確率を決定するのに有用な結果を生成するための方法を含む。以下にさらに記載する通り、定量的データは、アミノ酸、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質、ヌクレオチド、核酸、ヌクレオシド、糖、脂肪酸、ステロイド、代謝物、炭水化物、脂質、ホルモン、抗体、生物学的高分子のためのサロゲートとしての役割を果たす目的の領域、およびそれらの組合せを含むことができる。

0162

例えば、公共のデータベース、配列、または参考文献における受託番号により、本開示において特定された特定のバイオマーカーに加えて、本発明では、また、現在公知である、または後に発見される、本発明の方法のための有用性を有する例示の配列と少なくとも９０％または少なくとも９５％または少なくとも９７％同一であるバイオマーカー変異体の使用が検討される。これらの変異体は、多型、スプライス変異体、突然変異などを示しうる。この点において、本明細書は、本発明の文脈において、複数の当技術分野において公知のタンパク質を開示し、１つまたは複数の公的データベースならびにこれらの当技術分野において公知のタンパク質に関連する公開された雑誌論文への例示的な参考文献に関連付けられた例示的な受託番号を提供する。しかし、当業者は、開示されたバイオマーカーの追加の特徴を提供できる、追加の受託番号および雑誌記事を簡単に特定でき、例示の参照は、開示されたバイオマーカーに関して決して限定的ではないことを理解する。本明細書に記載される通り、種々の技術および試薬では、本発明の方法における使用が見出される。本発明の文脈における適切な試料は、例えば、血液、血漿、血清、羊水、膣分泌物、唾液、および尿を含む。一部の実施形態において、生物学的試料は、全血、血漿、および血清からなる群から選択される。特定の実施形態において、生物学的試料は血清である。本明細書において記載する通り、バイオマーカーは、当技術分野において公知の種々のアッセイおよび技術を介して検出することができる。本明細書においてさらに記載される通り、そのようなアッセイは、非限定的に、質量分析（ＭＳ）ベースのアッセイ、抗体ベースのアッセイならびに両者の側面を組み合わせたアッセイを含む。

0163

本明細書に記述されている反転対の成分であるタンパク質バイオマーカーとしては、例えば、インスリン様成長因子結合タンパク質４（ＩＢＰ４）、性ホルモン結合グロブリン（ＳＨＢＧ）、ビトロネクチン（ＶＴＮＣ）、群特異成分（ビタミンＤ結合タンパク質）（ＶＴＤＢ）、カテプシンＤ（リソソームアスパルチルプロテアーゼ）（ＣＡＴＤ）、妊娠特異的ベータ−１−糖タンパク質２（ＰＳＧ２）、インターアルファ−トリプシンインヒビター重鎖ファミリーメンバー４（ＩＴＩＨ４）、細胞接着分子Ｌ１様（ＣＨＬ１）、補体成分１、ＱサブコンポーネントＢ鎖（Ｃ１ＱＢ）、フィビュリン３（ＦＢＬＮ３）、ヘモペキシン（ＨＥＭＯまたはＨＰＸ）、インスリン様成長因子結合タンパク質６（ＩＢＰ６）、プロスタグランジンＤ２シンターゼ２１ｋＤａ（ＰＴＧＤＳ）が挙げられる。

0164

一部の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、図１を含む添付の図面および表のいずれかに列挙されている対を含む群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定することを含む方法を提供する。

0165

一部の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、ＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。

0166

本発明は、表２６に示されている群から選択される単離されたバイオマーカーを提供する。本発明のバイオマーカーは、妊娠女性の早産リスクを予測することができる。一部の実施形態では、単離されたバイオマーカーは、ＩＢＰ４、ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ、ＶＴＤＢ、ＣＡＴＤ、ＰＳＧ２、ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１、Ｃ１ＱＢ、ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ、およびＰＴＧＤＳからなる群から選択される。一部の実施形態では、単離されたバイオマーカーは、ＩＢＰ４、ＳＨＢＧ、ＰＳＧ３、ＬＹＡＭ１、ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ、ＩＢＰ３、ＩＮＨＢＣ、ＰＳＧ２、ＰＥＤＦ、ＣＤ１４、およびＡＰＯＣ３からなる群から選択される。

0167

本発明は、表２６に示されている群から選択される単離されたバイオマーカーの代用ペプチドを提供する。一部の実施形態では、単離されたバイオマーカーの代用ペプチドは、表２６に示されている代用ペプチドの群から選択される。本発明のバイオマーカーおよびそれらの代用ペプチドは、妊娠女性の早産リスクを予測するための方法に使用することができる。一部の実施形態では、代用ペプチドは、ＩＢＰ４、ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ、ＶＴＤＢ、ＣＡＴＤ、ＰＳＧ２、ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１、Ｃ１ＱＢ、ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ、およびＰＴＧＤＳからなる群から選択される単離されたバイオマーカーに対応する。一部の実施形態では、代用ペプチドは、ＩＢＰ４、ＳＨＢＧ、ＰＳＧ３、ＬＹＡＭ１、ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ、ＩＢＰ３、ＩＮＨＢＣ、ＰＳＧ２、ＰＥＤＦ、ＣＤ１４、およびＡＰＯＣ３からなる群から選択される単離されたバイオマーカーに対応する。

0168

本発明は、表２６に示されている群から選択される代用ペプチドに対応する安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を提供する。本発明のバイオマーカー、それらの代用ペプチド、およびＳＩＳペプチドは、妊娠女性の早産リスクを予測するための方法に使用することができる。一部の実施形態では、ＳＩＳペプチドは、ＩＢＰ４、ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ、ＶＴＤＢ、ＣＡＴＤ、ＰＳＧ２、ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１、Ｃ１ＱＢ、ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ、およびＰＴＧＤＳからなる群から選択される単離されたバイオマーカーの代用ペプチドに対応する。一部の実施形態では、ＳＩＳペプチドは、ＩＢＰ４、ＳＨＢＧ、ＰＳＧ３、ＬＹＡＭ１、ＩＧＦ２、ＣＬＵＳ、ＩＢＰ３、ＩＮＨＢＣ、ＰＳＧ２、ＰＥＤＦ、ＣＤ１４、およびＡＰＯＣ３からなる群から選択される単離されたバイオマーカーの代用ペプチドに対応する。

0169

一部の実施形態では、本発明は、満期対照と比較して早産リスクのある妊娠女性間で反転値の変化を示す単離されたバイオマーカーの対ＩＢＰ４／ＳＨＢＧを提供する。さらなる実施形態では、本発明は、満期対照と比較して早産リスクのある妊娠女性でより高い比を示す単離されたバイオマーカーの対ＩＢＰ４／ＳＨＢＧを提供する。

0170

一部の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、およびＣＡＴＤ／ＳＨＢＧからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定して、上記妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。追加の実施形態では、試料は、１９〜２１週のＧＡＢＤで得られる。さらなる実施形態では、試料は、１９〜２２週のＧＡＢＤで得られる。

0171

一部の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧの反転値を測定して、上記妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。追加の実施形態では、試料は、１９〜２１週のＧＡＢＤで得られる。さらなる実施形態では、試料は、１９〜２２週のＧＡＢＤで得られる。

0172

一部の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定して、上記妊娠女性の早産確率を決定することを含み、妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することが、妊娠女性の早産確率を決定する方法を提供する。追加の実施形態では、試料は、１９〜２１週のＧＡＢＤで得られる。さらなる実施形態では、試料は、１９〜２２週のＧＡＢＤで得られる。

0173

本発明の実施形態内には、妊娠女性の早産確率を決定するための反復方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、ＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対、および本明細書に記載および／または例示されているタンパク質から選択される、バイオマーカーの任意の他の対の反転値を測定して、上記妊娠女性の早産確率を決定することを含み、妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することが、妊娠女性の早産確率を決定する反復方法が含まれる。本明細書に記載の方法の反復実施は、単一試料から得られるその後の測定値、ならびにその後の試料を測定のために取得することを含む。例えば、リスクスコアとして表すことができる妊娠女性の早産確率が、指定されている値を超えていると決定される場合、上記方法を、同じ試料の異なる反転対、またはその後の試料の同じもしくは異なる反転対を繰り返し使用して、ｓＰＴＢのリスクをさらに階層化することができる。

0174

特定のバイオマーカーに加えて、本開示は、さらに、例示の配列と約９０％、約９５％、または約９７％同一であるバイオマーカー変異体を含む。変異体は、本明細書において使用される通り、多型、スプライス変異体、突然変異などを含む。反転値の変化は、タンパク質バイオマーカーを参照して説明されているが、バイオマーカーの対の、タンパク質発現レベルで特定してもよく、または遺伝子発現レベルで特定してもよい。

0175

追加のマーカーは、母体の特徴、病歴、過去の妊娠歴、および産科歴を含むが、これらに限定されない１つまたは複数のリスク兆候から選択することができる。そのような追加のマーカーは、例えば、以前の低出生体重または早期出産、複数の妊娠第２期自然流産、以前の妊娠第１期人工流産、家族性および世代間要因、不妊歴、未産、胎盤異常、子宮頸部および子宮の異常、短い子宮頸長の測定値、妊娠出血、子宮内発育制限、子宮内ジエチルスチルベストロール曝露、多胎妊娠、幼児の性別、低身長、低い妊娠前体重、低または高ボディ・マス・インデックス、糖尿病、高血圧、泌尿生殖器感染症（即ち、尿路感染症）、喘息、不安および抑うつ、喘息、高血圧、甲状腺機能低下症を含みうる。早産についての人口統計学的なリスク兆候は、例えば、母体年齢、人種／民族、単一婚姻状況、低い社会経済的地位、母体年齢、雇用関連の身体活動、職業曝露および環境曝露、ならびにストレスを含みうる。さらなるリスク兆候は、不適切な胎教、喫煙、マリファナおよび他の違法薬物の使用、コカイン使用、アルコール消費、カフェイン摂取、母体の体重増加、食事摂取、妊娠後期の間での性的活動、および余暇の身体活動を含みうる（Ｐｒｅｔｅｒｍ
Ｂｉｒｔｈ： Ｃａｕｓｅｓ， Ｃｏｎｓｅｑｕｅｎｃｅｓ， ａｎｄ Ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ、Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ （ＵＳ） Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ ｏｎ Ｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｉｎｇ Ｐｒｅｍａｔｕｒｅ Ｂｉｒｔｈ ａｎｄ Ａｓｓｕｒｉｎｇ Ｈｅａｌｔｈｙ Ｏｕｔｃｏｍｅｓ；Ｂｅｈｒｍａｎ ＲＥ、Ｂｕｔｌｅｒ ＡＳ編 Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ （ＤＣ）：Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｉｅｓ Ｐｒｅｓｓ （ＵＳ）；２００７年）。マーカーとして有用な追加のリスク兆候は、当技術分野において公知の学習アルゴリズム、例えば線形判別分析、サポートベクターマシン分類、再帰的特徴排除、マイクロアレイの予測分析、ロジスティック回帰、ＣＡＲＴ、ＦｌｅｘＴｒｅｅ、ＬＡＲＴ、ランダムフォレスト、ＭＡＲＴ、および／または生存分析回帰を使用して特定することができ、それらは、当業者に公知であり、本明細書にさらに記載されている。

0176

本明細書および添付の特許請求の範囲において使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」は、その内容が他に明確に指示しない限り、複数の参照対象を含むことに留意しなければならない。このように、例えば、「バイオマーカー」への参照は、２個またはそれ超のバイオマーカーの混合物などを含む。

0177

用語「約」は、特に所与の量を参照して、プラスまたはマイナス５パーセントの逸脱を包含することを意味する。

0178

添付の特許請求の範囲を含めた本願において使用する場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」は、その内容が他に明確に指示しない限り、複数の参照対象を含み、「少なくとも１つ」および「１つまたは複数」と互換的に使用される。

0179

本明細書において使用する場合、用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「含有する（ｃｏｎｔａｉｎｓ）」、「含有する（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」およびそれらの任意の変化形は、非排他的な包含を対象とすることを意図しており、エレメントまたはエレメントのリストを含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）、含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）、または含む（ｃｏｎｔａｉｎｓ）プロセス、方法、プロダクト・バイ・プロセス、または組成物は、それらのエレメントのみを含むわけではなく、そのようなプロセス、方法、プロダクト・バイ・プロセス、または組成物に明らかに列挙されていない、またはそれらに固有ではない他のエレメントを含みうる。

0180

本明細書において使用する場合、用語「パネル」は、１個または複数のバイオマーカーを含む組成物、例えばアレイまたはコレクションなどを指す。この用語は、また、本明細書において記載する１個または複数のバイオマーカーの発現パターンのプロファイルまたは指標を指しうる。バイオマーカーパネルのために有用なバイオマーカーの数は、バイオマーカー値の特定の組合せについての感度および特異度の値に基づく。

0181

本明細書で使用される場合、別様の指示がない限り、用語「単離された」および「精製された」は、一般的に、その天然環境（例えば、それが自然に存在する場合は、自然環境）から取り出されており、したがって、構造、機能、および特性の少なくとも１つに関して著しく異なる特徴を有するように、その天然状態から人為的に変更されている組成物を記述する。単離されたタンパク質または核酸は、それが自然界に存在する様式とは異なっており、合成ペプチドおよびタンパク質を含む。

0182

用語「バイオマーカー」は、生物学的分子、または生物学的分子の断片を指し、その変化および／または検出は、特定の身体条件または状態と相関しうる。用語「マーカー」および「バイオマーカー」は、本開示を通して互換的に使用される。例えば、本発明のバイオマーカーは、早産の増加した可能性と相関する。そのようなバイオマーカーは、任意の適切な分析物を含み、ヌクレオチド、核酸、ヌクレオシド、アミノ酸、糖、脂肪酸、ステロイド、代謝産物、ペプチド、ポリペプチド、タンパク質、炭水化物、脂質、ホルモン、抗体、生物学的高分子のためのサロゲートとしての役割を果たす目的の領域、およびそれらの組合せ（例えば、糖タンパク質、リボ核タンパク質、リポタンパク質）を含む生物学的分子を含むが、これらに限定されない。この用語は、また、生物学的分子の部分または断片、例えば、少なくとも５個の連続アミノ酸残基、少なくとも６個の連続アミノ酸残基、少なくとも７個の連続アミノ酸残基、少なくとも８個の連続アミノ酸残基、少なくとも９個の連続アミノ酸残基、少なくとも１０個の連続アミノ酸残基、少なくとも１１個の連続アミノ酸残基、少なくとも１２個の連続アミノ酸残基、少なくとも１３個の連続アミノ酸残基、少なくとも１４個の連続アミノ酸残基、少なくとも１５個の連続アミノ酸残基、少なくとも５個の連続アミノ酸残基、少なくとも１６個の連続アミノ酸残基、少なくとも１７個の連続アミノ酸残基、少なくとも１８個の連続アミノ酸残基、少なくとも１９個の連続アミノ酸残基、少なくとも２０個の連続アミノ酸残基、少なくとも２１個の連続アミノ酸残基、少なくとも２２個の連続アミノ酸残基、少なくとも２３個の連続アミノ酸残基、少なくとも２４個の連続アミノ酸残基、少なくとも２５個の連続アミノ酸残基、またはそれ超の連続アミノ酸残基を含むタンパク質またはポリペプチドのペプチド断片を包含する。

0183

本明細書で使用される場合、用語「代用ペプチド」は、ＭＲＭアッセイ構成で目的のバイオマーカーを定量化するための代用物としての役割を果たすように選択されているペプチドを指す。代用ペプチドの定量化は、ＭＲＭ検出技法と共に、安定同位体標識標準代用ペプチド（「ＳＩＳ代用ペプチド」または「ＳＩＳペプチド」）を使用すると、最も良好に達成される。代用ペプチドは合成であってもよい。例えば、アルギニンまたはリジンが、またはＭＲＭアッセイの内部標準としての役割を果たすペプチドのＣ末端の任意の他のアミノ酸が重標識されたＳＩＳ代用ペプチドを合成することができる。ＳＩＳ代用ペプチドは、天然に存在するペプチドではなく、その天然に存在する相当物と比較して著しく異なる構造および特性を有する。

0184

一部の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、ＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の比を測定して、上記妊娠女性の早産確率を決定することを含み、妊娠女性と満期対照との間に比の変化が存在することが、妊娠女性の早産確率を決定する方法を提供する。一部の実施形態では、比は、上方制御されたタンパク質を分子に含み、下方制御されたタンパク質を分母またはその両方に含んでいてもよい。例えば、本明細書で例示されているように、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧは、分子の上方制御されたタンパク質および分母の下方制御されたタンパク質の比であり、本明細書では「反転」と定義されている。比が、上方制御されたタンパク質を分子に含むか、または下方制御されたタンパク質を分母に含む場合、調節されなかったタンパク質は、標準化役割を果たすだろう（例えば、分析前変動性または分析変動性を低減する）。比が「反転」である特定の場合、増幅および標準化の両方が可能である。本発明の方法は、反転のサブセットに制限されず、バイオマーカーの比も包含すると理解される。

0185

本明細書で使用される場合、用語「反転」は、下方制御された分析物の測定値に対する上方制御された分析物の測定値の比を指す。一部の実施形態では、分析物値それ自体が、本明細書では応答比または相対比と呼ばれる、対応する安定同位体標準分析物のピーク面積の比に対する内因性分析物のピーク面積の比である。

0186

本明細書で使用される場合、用語「反転対」は、比較されているクラス間の値の変化を示す、対をなすバイオマーカーを指す。タンパク質濃度または遺伝子発現レベルの反転を検出することにより、データ標準化または集団全体にわたる閾値確立の必要性が排除される。一部の実施形態では、反転対は、満期対照と比較して早産リスクのある妊娠女性間で反転値の変化を示す単離されたバイオマーカーの対ＩＢＰ４／ＳＨＢＧである。さらなる実施形態では、反転対ＩＢＰ４／ＳＨＢＧは、満期対照と比較して早産リスクのある妊娠女性でより高い比を示す。任意の反転対の定義内には、個々のバイオマーカーが分子と分母との間で交換されている対応する反転対が包含される。当業者であれば、そのような対応する反転対は、その予測力に関して等しく有益な情報をもたらすことを認識するだろう。

0187

用語「反転値」は、下方制御された分析物の相対的ピーク面積に対する上方制御された分析物の相対的ピーク面積の比を指し、変動性の標準化および診断シグナル増幅の両方の役割を果たす。狭域ウィンドウ内のあらゆる考え得る反転の中から、個々の単変量性能に基づいてサブセットを選択することができる。本明細書に開示されているように、本明細書では反転値と呼ばれる、下方制御されたバイオマーカーの相対的ピーク面積に対する上方制御されたバイオマーカーの相対的ピーク面積の比を使用して、ロバストで正確な分類器を特定し、早産確率を予測し、満期出産の確率を予測し、出産時妊娠期間（ＧＡＢ）を予測し、出産までの時間を予測し、および／または妊娠女性の予防療法の進行をモニタリングすることができる。

0188

この反転法は、データ標準化に依存せず、過剰フィッティングの回避を支援し、診療所で簡単に実施される非常に単純な実験検査をもたらす、考え得る最も単純な分類器を提供するため有利である。本明細書に記載されているような、データ標準化に依存しない反転に基づくバイオマーカー対の使用は、臨床的に関連するＰＴＢバイオマーカーを特定するための方法として、非常に高い能力を有する。任意の単一タンパク質の定量化は、測定変動性、通常の流動性、および基線発現の個々の関連するばらつきにより引き起こされる不確実性の影響下にあるため、協調的および系統的な調節下にあり得るマーカー対を特定することは、個別化された診断および予後のよりロバストな方法であることが証明されるはずである。

0189

本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、単離されたバイオマーカーの対を含む組成物であって、上記バイオマーカーの対が、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示す組成物を提供する。一実施形態では、組成物は、上記バイオマーカーの各々に由来する代用ペプチドの安定同位体標識標準ペプチド（ＳＩＳペプチド）を含む。

0190

特定の実施形態では、本発明は、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示す、ＩＢＰ４およびＳＨＢＧからなる単離されたバイオマーカーの対を提供する。

0191

ＩＢＰ４は、インスリン様成長因子ＩＧＦ１およびＩＧＦ２を負に制御するインスリン様成長因子結合タンパク質（ＩＢＰ）のファミリーのメンバーである（Forbesら、Insulin-like growth factor I and II regulate the life cycle of trophoblast
in the developinghuman placenta.、Am J Physiol, Cell Physiol.、２００８年；２９４巻（６号）：Ｃ１３１３〜２２頁）。ＩＢＰ４は、合胞体栄養芽層（Crosleyら、IGFBP-4 and -5 are expressed in first-trimester villi and differentially regulate the migration ofHTR-8/SVneo cells.、Reprod Biol Endocrinol.、２０１４年；１２巻（１号）：１２３頁）により発現され、絨毛外栄養芽層により発現される支配的なＩＢＰである（Qiuら、Significance of IGFBP-4 in the development of fetal growth restriction.、J Clin Endocrinol Metab.、２０１２年；９７巻（８号）：Ｅ１４２９〜３９頁）。妊娠初期の母体ＩＢＰ４レベルは、満期妊娠と比較して、胎児発育遅延および子癇前症を併発した妊娠においてより高い。（Qiuら、
上記、２０１２年）

0192

ＳＨＢＧは、生物学的に活性な未結合ステロイドホルモンの利用能を制御する。Hammond GL.、Diverse roles for sex hormone-binding globulin in reproduction.、Biol Reprod.、２０１１年；８５巻（３号）：４３１〜４１頁。血漿ＳＨＢＧレベルは
、妊娠中に５〜１０倍増加し（Anderson DC.、Sex-hormone-binding globulin.、Clin
Endocrinol (Oxf).、１９７４年；３巻（１号）：６９〜９６頁）、胎盤栄養芽層細胞を含む肝外発現の証拠が存在する（Larreaら、Evidence that human placenta is a
site of sex hormone-binding globulin gene expression.、J Steroid Biochem Mol Biol.、１９９３年；４６巻（４号）：４９７〜５０５頁）。ＳＨＢＧレベルは、生理学的に、トリグリセリドレベル、インスリンレベル、およびＢＭＩと負に相関する（Simoら、Novel insights in SHBG regulation and clinical implications.、TrendsEndocrinol Metab.、２０１５年；２６巻（７号）：３７６〜８３頁）。ＳＨＢ
Ｇレベルに対するＢＭＩの影響は、部分には、ＢＭＩ階層化による予測性能の向上を説明することができる。

0193

羊水内感染症および炎症は、ＴＮＦ−αおよびＩＬ１−βを含む炎症促進性サイトカインのレベル増加を示すため、ＰＴＢと関連付けられている。（Mendelson CR. Minireview：fetal-maternal hormonal signaling in pregnancy and labor.、Mol Endocrinol.、２００９年；２３巻（７号）：９４７〜５４頁；Gomez-Lopezら、Immune cells
in term and preterm labor.、Cell Mol Immunol.、２０１４年；１１巻（６号
）：５７１〜８１頁）。肝臓でのＳＨＢＧ転写は、ＩＬ１−βおよびＮＦ−ｋＢ媒介性ＴＮＦ−αシグナル伝達（Simoら、Novel insights in SHBG regulation and clinical implications.、TrendsEndocrinol Metab.、２０１５年；２６巻（７号）：３７
６〜８３頁）、正常および異常陣痛の開始に関与する経路（Lindstrom TM、Bennett PR.、The role of nuclear factor kappa B in human labour.、Reproduction.、２００５年；１３０巻（５号）：５６９〜８１頁）により抑制される。ｓＰＴＢの運命にある女性のＳＨＢＧレベルが低いことは、感染症および／または炎症の結果である可能性がある。したがって、ＳＨＢＧは、上流の炎症性シグナルに応答した、胎盤胎児ユニットでのアンドロゲンおよびエストロゲン作用の制御に重要であり得る。

0194

一実施形態では、本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応する代用ペプチドの対を含む組成物であって、上記バイオマーカーの対が、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示す組成物を提供する。

0195

さらなる実施形態では、本発明は、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルであって、上記対が各々、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すパネルを提供する。

0196

追加の実施形態では、本発明は、代用ペプチドの少なくとも２対のパネルであり、代用ペプチドの上記対が各々、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの対に対応するパネルであって、上記対が各々、早産リスクのある妊娠女性と満期対照との間で反転値の変化を示すパネルを提供する。

0197

一実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。

0198

別の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、ＩＢＰ４／ＳＨＢＧ、ＶＴＮＣ／ＶＴＤＢ、ＶＴＮＣ／ＳＨＢＧ、ＣＡＴＤ／ＳＨＢＧ、ＰＳＧ２／ＩＴＩＨ４、ＣＨＬ１／ＩＴＩＨ４、ＰＳＧ２／Ｃ１ＱＢ、ＰＳＧ２／ＦＢＬＮ３、ＨＰＸ／ＩＢＰ４、およびＨＰＸ／ＰＴＧＤＳからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルの反転値の変化を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、反転値は、妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することを明らかにし、妊娠女性の早産確率を示す。一部の実施形態では、測定ステップは、妊娠女性から得られた生物学的試料中のバイオマーカーの代用ペプチドを測定することを含む。

0199

一実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、妊娠女性の表１〜７７および図１〜１１１のいずれかに列挙されているバイオマーカーからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。

0200

追加の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、妊娠女性の表２７〜５９、６１〜７２、７６、および７７に指定されているバイオマーカー対からなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。

0201

さらなる実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、妊娠女性の表２６に列挙されているバイオマーカーからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも１対の反転値を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。

0202

別の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、妊娠女性の表１〜７７および図１〜１１１のいずれかに指定されているバイオマーカー対からなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルの反転値の変化を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、反転値は、妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することを明らかにし、妊娠女性の早産確率を示す。一部の実施形態では、測定ステップは、妊娠女性から得られた生物学的試料中のバイオマーカーの代用ペプチドを測定することを含む。

0203

別の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、妊娠女性の表２７〜５９、６１〜７２、７６、および７７に指定されているバイオマーカー対からなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルの反転値の変化を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、反転値は、妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することを明らかにし、妊娠女性の早産確率を示す。一部の実施形態では、測定ステップは、妊娠女性から得られた生物学的試料中のバイオマーカーの代用ペプチドを測定することを含む。

0204

別の実施形態では、本発明は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法であって、妊娠女性から得られた生物学的試料中の、妊娠女性の表２６に指定されているバイオマーカーからなる群から選択される、バイオマーカーの少なくとも２対のパネルの反転値の変化を測定して、妊娠女性の早産確率を決定することを含む方法を提供する。一部の実施形態では、反転値は、妊娠女性と満期対照との間に反転値の変化が存在することを明らかにし、妊娠女性の早産確率を示す。一部の実施形態では、測定ステップは、妊娠女性から得られた生物学的試料中のバイオマーカーの代用ペプチドを測定することを含む。

0205

出産までの時間を断定（predicate）することに向けられる方法については、「出産、
出生」は、破水を伴うまたは伴わない、陣痛の自然発症に続く出産を意味すると理解される。

0206

妊娠女性において早産についての確率を決定する方法を参照して記載および例示したが、本開示は、出生時の妊娠期間（ＧＡＢ）を予測する方法、満期出産を予測するための方法、妊娠女性において満期出産の確率を決定するための方法、ならびに妊娠女性において出産までの時間（ＴＴＢ）を予測する方法に、同様に適用可能である。上記方法の各々が、母体−胎児の健康上の考慮事項に関する特定の実質的な有用性および利益を有することが、当業者には明らかであろう。

0207

さらに、本開示は、妊娠女性の早産確率を決定するための方法を参照して記載および例示されているが、同様に、異常グルコース検査、妊娠糖尿病、高血圧症、子癇前症、子宮内胎児発育遅延、死産、胎児発育遅延、ＨＥＬＬＰ症候群、羊水過少（oligohyramnios）、絨毛羊膜炎、絨毛羊膜炎、前置胎盤、癒着胎盤（placental acreta）、剥離、早期剥
離胎盤、胎盤出血、予定日前の早期破水、早期陣痛、不利な子宮頚部、過期妊娠、胆石症、子宮過膨張（uterine over distention）、ストレスを予測するための方法に応用可
能である。下記でより詳細に記載されているように、本明細書に記載の分類器は、例えば、子癇前症または妊娠糖尿病等の状態に基づいて医学的に示されたＰＴＢの成分に感受性である。

0208

一部の実施形態では、本開示は、ＩＴＩＨ４／ＣＳＨの使用により本明細書で例示されている、出産までの時間（ＴＴＢ）の強力な予測因子であるバイオマーカー、バイオマーカー対、および／または反転を提供する（図１０）。ＴＴＢは、ＧＡＢＤと出産時妊娠期間（ＧＡＢ）との間の差として定義される。この発見は、個々にまたはそのような分析物の数学的な組合せのいずれかで、ＴＴＢまたはＧＡＢの予測を可能にする。症例対対照の差異を欠如するが、妊娠全体にわたって分析物強度の変化を示す分析物は、本発明の方法による妊娠時計に有用である。他の障害の早産の診断を行うことができない複数の分析物の較正を使用して、妊娠日数を決定することができる可能性がある。そのような妊娠時計は、別の測定による日数決定（例えば、最終月経および／または超音波による日数決定）を確認するために、または例えばｓＰＴＢ、ＧＡＢ、もしくはＴＴＢを単独で事後におよびより正確に予測するために有用である。本明細書では「時計タンパク質」とも呼ばれるこうした分析物を、他の日数決定法を用いずにまたは他の日数決定法と共に使用して、妊娠日数を決定することができる。表６０は、ＴＴＢおよびＧＡＢを予測するための本発明の妊娠時計に有用な時計タンパク質のリストを提供する。

0209

追加の実施形態において、妊娠女性において早産についての確率を決定する方法は、さらに、早産に関連する１つまたは複数のリスク兆候についての測定可能な特徴を検出することを包含する。追加の実施形態において、リスク兆候は、以前の低出生体重または早期出産、複数の妊娠第２期自然流産、以前の妊娠第１期人工流産、家族性および世代間要因、不妊歴、未産、妊婦、初妊婦、経産婦、胎盤異常、子宮頸部および子宮の異常、妊娠出血、子宮内発育制限、子宮内ジエチルスチルベストロール曝露、多胎妊娠、幼児の性別、低身長、低い妊娠前体重、低または高ボディ・マス・インデックス、糖尿病、高血圧、および泌尿生殖器感染症からなる群から選択される。

0210

「測定可能な特徴」は、対象において早産についての確率で決定することができ、それと相関させることができる任意の特徴、特徴、または態様である。この用語は、さらに、妊娠女性におけるＧＡＢの予測、満期出産の予測、または出産までの時間の予測との関連において決定することができ、それと相関させることができる任意の特徴、特徴、または態様を包含する。バイオマーカーについては、そのような測定可能な特徴は、例えば、生物学的試料におけるバイオマーカーまたはその断片の存在、非存在、もしくは濃度、変化した構造、例えば、翻訳後修飾の存在もしくは量、例えばバイオマーカーのアミノ酸配列上の１つまたは複数の位置での酸化など、または、例えば、出産予定日制御（term control）対象におけるバイオマーカーの立体構造と比較して変化した立体構造の存在、およ
び／または、１個を上回るバイオマーカーのプロファイルの一部としてのバイオマーカーの存在、量、もしくは変化した構造などを含みうる。

0211

バイオマーカーに加えて、測定可能な特徴は、さらに、例えば、母体の特徴、年齢、人種、民族、病歴、過去の妊娠歴、産科歴、を含む、リスク兆候を含みうる。リスク兆候については、測定可能な特徴は、例えば、以前の低出生体重または早期出産、複数の妊娠第２期自然流産、以前の妊娠第１期人工流産、家族性および世代間要因、不妊歴、未産、胎盤異常、子宮頸部および子宮の異常、短い子宮頸長の測定値、妊娠出血、子宮内発育制限、子宮内ジエチルスチルベストロール曝露、多胎妊娠、幼児の性別、低身長、低い妊娠前体重／低ボディ・マス・インデックス、糖尿病、高血圧、泌尿生殖器感染症、甲状腺機能低下症、喘息、低学業成績、喫煙、薬物使用、およびアルコール消費を含みうる。

0212

一部の実施形態では、本発明の方法は、体格指数（ＢＭＩ）を算出することを含む。

0213

一部の実施形態において、早産の確率を決定するための開示方法は、質量分析、捕捉剤、またはそれらの組合せを使用して１個または複数のバイオマーカーを検出および／または定量化することを包含する。

0214

追加の実施形態において、妊娠女性において早産についての確率を決定する開示方法は、妊娠女性からの生物学的試料を用意する最初のステップを包含する。

0215

一部の実施形態において、妊娠女性において早産についての確率を決定する開示方法は、医療提供者に確率を連絡することを包含する。ＧＡＢを予測する開示方法、満期出産を予測するための方法、妊娠女性において満期出産の確率を決定するための方法、ならびに妊娠女性において出産までの時間を断定する方法は、同様に、医療提供者に確率を連絡することを包含する。上記の通り、妊娠女性において早産についての確率を決定することを参照して記載および例示したが、本開示を通して記載した全ての実施形態は、ＧＡＢを予測する方法、満期出産を予測するための方法、妊娠女性において満期出産の確率を決定するための方法、ならびに妊娠女性において出産までの時間を断定する方法に、同様に適用可能である。具体的には、早産についての方法を明らかに参照した、本願を通して挙げられるバイオマーカーおよびパネルは、ＧＡＢを予測するための方法、満期出産を予測するための方法、妊娠女性において満期出産の確率を決定するための方法、ならびに妊娠女性において出産までの時間を断定する方法において使用することもできる。上記方法の各々が、母体−胎児の健康上の考慮事項に関する特定の実質的な有用性および利益を有することが、当業者には明らかであろう。

0216

追加の実施形態において、連絡によって、妊娠女性のために、その後の処置の決定を通知する。一部の実施形態において、妊娠女性において早産についての確率を決定する方法は、リスクスコアとして確率を表現する追加の特徴を包含する。

0217

本明細書で開示されている方法では、妊娠女性の早産確率を決定することは、出産時妊娠期間が既知である早産妊娠および満期妊娠のコホートの群から選択される単離されたバイオマーカーの比を測定することにより確率／リスク指標を形成することを含む初期ステップを包含する。個々の妊娠の場合、妊娠女性の早産確率を決定することは、確率／リスク指標を生成する初期ステップで使用したものと同じ測定方法を使用して、単離されたバイオマーカーの比を測定すること、および測定したリスク指標の比を比較して、個々の妊娠の個別化リスクを導出することを包含する。一実施形態では、早産リスク指標は、出産時妊娠期間が記録されている早産妊娠および満期妊娠のコホートでＩＢＰ４／ＳＨＢＧの比を測定することにより形成される。その後、臨床業務では、個々の妊娠でのＩＢＰ４／ＳＨＢＧの測定された比を、指標群でＩＢＰ４／ＳＨＢＧを導出したのと同じ単離および測定技法を使用して指標と比較して、早産リスクを導出する。

0218

本明細書において使用する場合、用語「リスクスコア」は、妊娠女性から得られた生物学的試料中の１個または複数のバイオマーカーの量あるいは反転値を、妊娠女性のランダムプールから得られた生物学的試料から算出された１個または複数のバイオマーカーの平均量を表す標準スコアまたは基準スコアと比較することに基づいて割り当てることができるスコアを指す。一部の実施形態では、リスクスコアは、反転値、つまり個々のバイオマーカーの相対強度の比の対数として表される。当業者であれば、リスクスコアが、各種データ変換に基づいてならびに比自体として表すことができることを理解するだろう。さらに、特に反転対に関して、いかなる比は、分子および分母のバイオマーカーを交換しても同様に有用な情報をもたらすこと、または関連するデータ変換（例えば減算）が適用されることを、当業者であれば理解するだろう。バイオマーカーのレベルは妊娠を通して静的ではない可能性があるため、標準スコアまたは基準スコアは、試料が採取された時に妊娠女性のそれに対応する、妊娠時点について得られている必要がある。標準スコアまたは基準スコアを事前に決定し、予測モデル中に組み込むことができ、比較が、確率が対象について決定される毎に実際に実施するのではなく、間接的であるようにする。リスクスコアは、標準（例えば、番号）または閾値（例えば、グラフ上のライン）でありうる。リスクスコアの値は、妊娠女性のランダムプールから得られた生物学的試料から算出された１個または複数のバイオマーカーの平均量から上方または下方への逸脱と相関する。ある特定の実施形態において、リスクスコアが標準リスクスコアまたは基準リスクスコアよりも大きい場合、妊娠女性は、早産の増加した可能性を有する可能性がある。一部の実施形態において、妊娠女性のリスクスコアの大きさ、または基準リスクスコアを超える量は、その妊娠女性のリスクのレベルを示しうる、またはそれと相関しうる。

0219

本明細書で例示されているように、ＰｒｅＴＲＭ（商標）分類器は、ＩＢＰ４ペプチドトランジション（ＱＣＨＰＡＬＤＧＱＲ＿３９４．５＿４７５．２）およびＳＨＢＧペプチドトランジション（ＩＡＬＧＧＬＬＦＰＡＳＮＬＲ＿４８１．３＿６５７．４）のＳＩＳ標準化強度の自然対数であると定義される。スコア＝ｌｎ（Ｐ１ｎ／Ｐ２ｎ）であり、式中Ｐ１ｎおよびＰ２ｎは、それぞれＩＢＰ４およびＳＨＢＧトランジションのＳＩＳ標準化ピーク面積値である。ＳＩＳ標準化は、対応するＳＩＳピーク面積で除算された内因性ピーク面積の相対比として定義される。例えば、Ｐ１ｎ＝Ｐ１ｅ／Ｐ１ＳＩＳであり、式中Ｐ１ｅ＝ＩＢＰ４内因性トランジションピーク面積、およびＰ１ＳＩＳ＝ＩＢＰ４ ＳＩＳトランジションのピーク面積。ＰｒｅＴＲＭ（商標）スコアの分布と、対応する有病率調整陽性予測値との関連性を特定することにより、ｓＰＴＢの確率を、それらのスコアの決定に基づいて未知対象に割り当てることができる。この関係性または関連性は、図２５に示されており、検査室測定を臨床予測に結び付けるものである。

0220

ＰｒｅＴＲＭ（商標）分類器は、ＩＢＰ４ペプチドトランジション（ＱＣＨＰＡＬＤＧＱＲ＿３９４．５＿４７５．２）およびＳＨＢＧペプチドトランジション（ＩＡＬＧＧＬＬＦＰＡＳＮＬＲ＿４８１．３＿６５７．４）のＳＩＳ標準化強度の自然対数として定義されるが、本発明は、複数の反転を含む分類器も含む。性能向上は、１つを超える反転から形成される予測因子を構築することにより達成することができる。したがって、追加の実施形態では、本発明の方法は、例えば、別々のＧＡＢＤウィンドウ、予定日前の早期破水（ＰＰＲＯＭ）対ＰＰＲＯＭを伴わない早期陣痛（ＰＴＬ）、胎児性別、初妊婦対経産婦について、強力な予測性能を示す複数の反転を含む。この実施形態は、妊娠期間範囲の初期（例えば、１７〜１９週）または後期（例えば、１９〜２１週）のいずれかで強力な予測性能を生成したいずれかの反転に関して、実施例１０および表６１に例示されている。例示されているように、複数の反転の組合せ（ＳｕｍＬｏｇ）から形成された予測因子の性能を、血液採取範囲全体にわたって評価し、個々の反転の対数値の合計（ＳｕｍＬｏｇ）から予測因子スコアを導出した。当業者であれば、他のモデル（例えば、ロジスティック回帰）を選択して、１つを超える反転から形成される予測因子を構築することができる。

0221

本発明の方法は、公知の臨床因子、例えば、血液採取期間、胎児性別、妊娠回数、ならびに任意の判別可能な患者特徴および／または本出願にわたって記載されている危険リスクに基づいて反転の１つまたはサブセットを選択する指標変数を含む分類器をさらに含む。この実施形態は、実施例１０、表６１〜６４に例示されており、それらには、ｓＰＴＢ、ＰＰＲＯＭ、およびＰＴＬの２つの異なる表現型の反転性能（１７〜２１週）が独立して例示されている。同様に、この実施形態は、実施例１０、表７６および７７、ならびに図１０８および１０９に例示されており、それらには、ｓＰＴＢの２つの異なる表現型である予定日前の早期破水（ＰＰＲＯＭ）およびＰＰＲＯＭを伴わない早期陣痛（ＰＴＬ）の反転性能（１９〜２１週）が独立して例示されている。したがって、本発明の方法は、ＰＰＲＯＭおよびＰＴＬの独立予測因子を構築するために、または上記に記載のような単一予測因子の１つを超える反転の組合せを用いて性能を全体的に最大化にするために、反転を選択することを含む。この実施形態は、実施例１０、表６５〜６８にさらに例示されており、それらには、２つの異なるタイプのｓＰＴＢ、つまり初妊婦および経産婦の反転性能（１７〜２１週）が独立して例示されている。この実施形態は、実施例１０、表６９〜７２および図１０６にさらに例示されており、それらには、胎児性別に基づく２つの異なるタイプのｓＰＴＢの反転性能（１７〜２１週）が独立して例示されている。本発明の方法は、ＰＰＲＯＭおよびＰＴＬ、妊娠回数、ならびに胎児性別に関して例示されているが、ＧＡＢＤ、または本明細書に記載のまたはそうでなければ当業者に公知の任意の公知の臨床因子／リスク因子に基づいて反転の１つまたはサブセットを選択する指標変数を含む分類器を含む。指標変数を含む分類器を有する代わりとして、本発明は、ＧＡＢＤ、または本明細書に記載のまたはそうでなければ当業者に公知の任意の公知の臨床因子／リスク因子に基づいて妊婦のサブセットに適合する別々の分類器をさらに提供する。例えば、この実施形態は、各時間ウィンドウで最も性能のよい反転に基づく、連続および／または重複するＧＡＢＤの時間ウィンドウのための別々の分類器を包含する。

0222

本明細書で例示されているように、特許請求されている方法の予測性能は、２２ｋｇ／ｍ２超のおよび３７ｋｇ／ｍ２と等しいかまたはそれ未満のＢＭＩ階層化で向上させることができる。したがって、一部の実施形態では、本発明の方法は、指定されているＢＭＩを有する妊娠女性から得られた試料で実施してもよい。手短に言えば、ＢＭＩは、個体のキログラム重量を、メートルで表される高さの２乗で除算したものである。ＢＭＩは、体脂肪を直接的に測定するものではないが、皮下脂肪厚測定、生体電気インピーダンス法、デンシトメトリー（水面下体重測定）法、二重エネルギーＸ線吸収法（ＤＸＡ）、および他の方法から得られる体脂肪のより直接的な測定値と、ＢＭＩが相関することを示す研究がある。さらに、ＢＭＩは、身体肥満のより直接的な尺度であるため、種々の代謝および疾患転帰と強く相関すると考えられる。一般的に、１８．５未満のＢＭＩを有する個体は、体重不足であるとみなされ、１８．５またはそれ超から２４．９までのＢＭＩを有する個体は、標準体重であるとみなされ、２５．０またはそれ超から２９．９までのＢＭＩを有する個体は、太り過ぎであるとみなされ、３０．０またはそれ超のＢＭＩを有する個体は、肥満であるとみなされる。一部の実施形態では、特許請求されている方法の予測性能は、１８もしくはそれ超の、１９もしくはそれ超の、２０もしくはそれ超の、２１もしくはそれ超の、２２もしくはそれ超の、２３もしくはそれ超の、２４もしくはそれ超の、２５もしくはそれ超の、２６もしくはそれ超の、２７もしくはそれ超の、２８もしくはそれ超の、２９もしくはそれ超の、または３０もしくはそれ超のＢＭＩ階層化により向上させることができる。他の実施形態では、特許請求されている方法の予測性能は、１８もしくはそれ未満の、１９もしくはそれ未満の、２０もしくはそれ未満の、２１もしくはそれ未満の、２２もしくはそれ未満の、２３もしくはそれ未満の、２４もしくはそれ未満の、２５もしくはそれ未満の、２６もしくはそれ未満の、２７もしくはそれ未満の、２８もしくはそれ未満の、２９もしくはそれ未満の、または３０もしくはそれ未満のＢＭＩ階層化により向上させることができる。

0223

本発明の文脈において、用語「生物学的試料」は、妊娠女性から採取された任意の試料を包含し、本明細書中に開示されるバイオマーカーの１個または複数を含む。本発明の文脈において適切な試料は、例えば、血液、血漿、血清、羊水、膣分泌物、唾液、および尿を含む。一部の実施形態において、生物学的試料は、全血、血漿、および血清からなる群から選択される。特定の実施形態において、生物学的試料は血清である。当業者により理解される通り、生物学的試料は、血液の任意の画分または成分、非限定的に、Ｔ細胞、単球、好中球、赤血球、血小板、および微小胞、例えばエキソソームおよびエキソソーム様小胞などを含みうる。特定の実施形態において、生物学的試料は血清である。